[发明专利]一种含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物及其制备方法和应用在审
| 申请号： | 202210716077.3 | 申请日： | 2022-06-22 |
| 公开（公告）号： | CN115109110A | 公开（公告）日： | 2022-09-27 |
| 发明（设计）人： | 黄磊;赵万年;沈奇;肖潇;缪佳颖 | 申请（专利权）人： | 江苏申基生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C07H19/207 | 分类号： | C07H19/207;C07H21/02;C07H1/00;C12N15/11;C12P19/34 |
| 代理公司： | 南京材智汇知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32449 | 代理人： | 乔淑媛;吴玲燕 |
| 地址： | 210000 江苏省南京市江北新区智能*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 含六元糖环 结构 起始 寡核苷酸 引物 及其 制备 方法 应用 | ||
1.一种含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物，其特征在于，其包含以下结构：
其中，X1、X2和X3分别独立的为O、CH2或NH；
Y1、Y2和Y3分别独立的为O、S、Se或BH3；
Ra为Rb为且当Ra为时，Rb为
R1、R2和R3、R6、R7、R8独立的为氢、羟基、取代或未取代的O-烷基、取代或未取代的S-烷基、取代或未取代的NH-烷基、取代或未取代的N-二烃基、取代或未取代的O-芳香基、取代或未取代的S-芳香基、取代或未取代的NH-芳香基、取代或未取代的O-芳烷基、取代或未取代的S-芳烷基、取代或未取代的NH-芳烷基；
R4和R5独立的为H、OH、烷基、O-烷基、卤素；
B1和B2独立的为天然的、或修饰的、或非天然的核苷碱基。
2.权利要求1所述的含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)中间体K的合成：从山梨糖醇出发合成化合物A，在化合物A的基础上依次进行糖苷化、磷酸化、单磷酸咪唑化，二磷酸化、N7的甲基化、多磷酸的咪唑化等反应，合成中间体K；(2)磷酸酯键连接的二核苷酸的制备：通过亚磷酰胺单体与双取代核苷单体，在四氮唑的作用下偶联形成第一个磷酸酯键，通过酸作用，脱除保护基，然后引入第二个磷酸，最终水解得到磷酸酯键连接的二核苷酸；(3)含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物的合成：中间体K与磷酸酯键连接的二核苷酸反应制备含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物；
所述亚磷酰胺单体结构式为：
其中，R9为H、OH、烷基、O-烷基、卤素；R10为氢、羟基、取代或未取代的O-烷基、取代或未取代的S-烷基、取代或未取代的NH-烷基、取代或未取代的N-二烃基、取代或未取代的O-芳香基、取代或未取代的S-芳香基、取代或未取代的NH-芳香基、取代或未取代的O-芳烷基、取代或未取代的S-芳烷基、取代或未取代的NH-芳烷基；
B3和B4独立的为天然的、或修饰的、或非天然的核苷碱基。
3.权利要求1所述的含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物的应用，其特征在于：该含六元糖环结构的起始加帽寡核苷酸引物的mRNA加帽，使用T7 RNA聚合酶。
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