[发明专利]细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法

说明书

本发明提供一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法，包括以下步骤：阵列扫描玻片获得多个原始图像；按最小分辨率裁剪原始图像；将最小分辨率图像拼接成全视野图；以目标检测模型获取可疑细胞位置；垃圾分类模型剔除垃圾细胞；阴阳分类模型识别阳性细胞；同步的，确定图像的最佳分辨率，按最佳分辨率裁剪各个原始图像，根据拼接坐标数据和缩放比将各个最佳分辨率图像进行拼接，获得最佳分辨率拼接图像；根据可疑细胞位置数据、垃圾细胞位置数据、阳性细胞位置数据将标记添加到最佳分辨率拼接图像；通过以上步骤实现细胞图像高清晰快速拼接识别标记。本发明大幅提高拼接识别标记效率。

技术领域

本发明涉及细胞图像处理方法，属于医学影像处理领域，特别是一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法。

背景技术

现有技术中，采集细胞进行图像识别，是筛查的有效措施。例如中国专利文献CN110797097A人工智能云诊断平台中记载的方案，能够使细胞筛查服务普及到偏远地区和医疗资源不足地区。现有技术的措施是先以阵列式扫描显微镜将图像扫描，然后进行拼接和识别。本发明的申请人研发并且推出了能够利用手机进行细胞图像扫描采集的方案，进一步降低了阵列式扫描显微镜成本，例如专利文献CN110879999A记载的基于手机的微型显微图像采集装置及图像拼接、识别方法中记载的方案。但是由于手机采集的图像尺寸较大，通常每张图片有3~10MB大小，而通常一个玻片需要采集30*40张合计1200张图片进行拼接。因此一张拼合起来的图像，保存尺寸通常需要3.6GB，而在运行过程中占用的资源更多。例如CN110807732A用于显微图像全景拼接系统及方法中记载的拼接方法，需要扫描图像的重叠区域进行调节，这也需要占用大量的时间。为提高识别效率，技术人员采用了缩小图片尺寸的进行处理的方案，例如CN111651268A显微图像快速处理系统中记载的方案。但是将图片尺寸缩小后虽然能够提高速度，也导致最终图像中的冗余信息较少，医师在阅读时缺少可供进一步的分析的图像信息。即在现有技术中，图像识别的效率与准确度之间存在互相矛盾的情形。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法，能够在提高识别效率的同时，在最终图像中提供高分辨率的图像，以具有足够的冗余信息供医师分析。

为解决上述技术问题，本发明所采用的技术方案是：一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法，包括以下步骤：

S1、阵列扫描玻片获得多个原始图像；

S2、确定图像可供识别的最小分辨率，按最小分辨率裁剪原始图像；

S3、将最小分辨率图像拼接成全视野图，储存拼接坐标数据；

S4、以目标检测模型获取可疑细胞位置，储存可疑细胞位置数据；

S5、垃圾分类模型剔除垃圾细胞，储存垃圾细胞位置数据；

S6、阴阳分类模型识别阳性细胞，储存阳性细胞位置数据；

S01、与S1同步的，确定图像的最佳分辨率，按最佳分辨率裁剪各个原始图像，根据拼接坐标数据和缩放比将各个最佳分辨率图像进行拼接，获得最佳分辨率拼接图像；

S02、根据可疑细胞位置数据、垃圾细胞位置数据、阳性细胞位置数据将标记添加到最佳分辨率拼接图像；

通过以上步骤实现细胞图像高清晰快速拼接识别标记。

优选的方案中，在步骤S1中，阵列扫描玻片过程中，控制每次扫描的步进值相同，根据扫描路径获得各个图片的行列值，并储存。

优选的方案中，在步骤S3中，拼接的具体步骤为：

S31、读取1行1列和1行2列图像，扫描像素获得图像重叠视野，将图像重叠视野水平堆叠拼接；

同步的，读取1行1列和2行1列图像，扫描像素获得图像重叠视野，将图像重叠视野垂直堆叠拼接；