[发明专利]一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用在审
申请号: | 202210790399.2 | 申请日: | 2022-07-06 |
公开(公告)号: | CN115851962A | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 赵桂苹;文杰;崔焕先;朱雨婷;刘丽 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市诚辉律师事务所 11430 | 代理人: | 范盈 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 腹脂重 性状 相关 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种与鸡的腹脂重性状相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记序列为ACACATCAGATTTCAATCTCG/AGCAGCCATGGGATCATTTTC,对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus-6.0版本序列信息11号染色体,其中第18,362,638位的碱基为G或A,基因型为GG、GA、AA;GG基因型腹脂重低于GA型和AA基因型。
2.一种检测权利要求1所述的与鸡腹脂重性状相关的SNP分子标记的引物,其特征在于,包括:
上游引物F:ATGCTCACCTGGAATAACCCC;
下游引物R:GCGCAGATAAGATGGCAGGTA。
3.一种权利要求2所述的引物在检测鸡的腹脂重性状或制备检测鸡的腹脂性状的试剂盒中的应用,其特征包括权利要求2中的引物。
4.一种检测鸡腹脂重性状的方法,其特征在于,检测待测样本鸡中如权利要求1所述的SNP分子标记的基因型。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测鸡的基因组DNA;
(2)检测待测鸡11号染色体第18,362,638位SNP分子标记的基因型;
(3)利用权利要求2所述的引物进行PCR扩增,获取扩增产物;
(3)直接测序法对获得的PCR扩增产物进行等位基因测序;
(4)基于所述测序结果,确定待测鸡如权利要求1所述的SNP标记的基因型。
6.权利要求1所述SNP分子标记在鉴定鸡腹脂重基因型并应用于低腹脂鸡育种中的应用。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,检测鸡国际参考基因组6.0版本11号染色体上chr11:18362638的基因型,表明携带GG基因型的个体具有较低的腹脂沉积。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤(1)中所述提取待测鸡的基因组DNA的方法为:对待测鸡进行鸡翅静脉采血,用抗凝剂进行抗凝处理后经裂解、蛋白酶消化处理,然后采用酚仿法提取基因组DNA,以ddH2O溶解。
9.一种权利要求1所述的SNP分子标记和\或权利要求2所述的引物在鸡育种中的应用。
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