[发明专利]玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记、引物组及检测方法

权利要求书

1.一种玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记，其特征在于，包括KA002081和KA002084；

KA002081位于玉米基因序列的8号染色体154681279bp处，KA002084位于其8号染色体155270367bp处；

KA002081的等位基因位点为T或A；KA002084的等位基因位点为C或G。

2.根据权利要求1所述一种玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记，其特征在于，KA002081的抗病等位基因位点为A；KA002084的抗病等位基因位点为G。

3.根据权利要求1所述一种玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记，其特征在于，所述玉米基因序列为玉米品种B73的参考基因序列。

4.权利要求1～3任意一项所述玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记在玉米育种中的应用。

5.一种引物组，其特征在于，所述引物组用于扩增玉米基因组，并检测权利要求1～4任意一项所述的玉米抗大斑病Ht3基因紧密连锁SNP分子标记。

6.根据权利要求5所述一种引物组，其特征在于，用于检测KA002081的引物组包括如序列SEQ ID NO.1所示的第一正向引物、如序列SEQ ID NO.2所示的第二正向引物和如序列SEQ ID NO.3所示的反向引物；

用于检测KA002084的引物组包括如序列SEQ ID NO.4所示的第一正向引物、如序列SEQID NO.5所示的第二正向引物和如序列SEQ ID NO.6所示的反向引物。

7.一种检测玉米大斑病抗性基因Ht3基因型的方法，其特征在于，采用权利要求6或7所述的引物组分别检测玉米样品的基因组中，KA002081的抗病等位基因位点和KA002084的抗病等位基因位点；

当KA002081的抗病等位基因位点为A，并且KA002084的抗病等位基因位点为G时，判定所述玉米样品具有Ht3基因型。

8.根据权利要求7所述一种检测玉米大斑病抗性基因Ht3基因型的方法，其特征在于，采用所述引物组通过KASP检测方法对所述玉米样品的基因组进行检测。

9.根据权利要求8所述一种检测玉米大斑病抗性基因Ht3基因型的方法，其特征在于，所述KASP检测方法使用的荧光序列分别为FAM荧光序列和HEX荧光序列。

10.一种玉米大斑病抗病性分子标记辅助育种的方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1、获得基因组中含有玉米大斑病抗性基因Ht3的标记位点KA002081和KA002084的第一玉米植物；

S2、将所述第一玉米植物与其他玉米植物杂交，得到子代植物；

S3、采用权利要求8或9所述的方法检测所述子代植物中玉米大斑病抗性基因Ht3基因型，并筛选出具有Ht3基因型的子代植物，完成育种。