[发明专利]lncRNA LINREP在胶质瘤诊断、预后和治疗中的应用

说明书

本发明属于生物医药和分子生物学技术领域，具体涉及lncRNA LINREP在胶质瘤诊断、预后和治疗中的应用。本发明筛选出在胶质瘤/瘤旁/正常脑组织中差异表达同时与PTBP1特异性结合的lncRNA LINREP，且证明其是胶质瘤患者的不良预后因素。同时进一步确定了LINREP通过抑制PTBP1的泛素‑蛋白酶体降解途径增强PTBP1蛋白稳定性，从而促进PTBP1介导RTN4 3号外显子跳跃突变的分子调控机制，并从msupgt;6/supgt;A甲基化修饰角度探究LINREP异常表达的上游调控机制。本发明对LINREP在胶质瘤中的临床价值、生物学功能及分子机制进行深入探索，有望开发其在脑胶质瘤诊断、预后及治疗中的应用。

技术领域

本发明属于生物医药和分子生物学技术领域，具体涉及lncRNA LINREP在胶质瘤诊断、预后和治疗中的应用。

背景技术

公开该背景技术部分的信息仅仅旨在增加对本发明的总体背景的理解，而不必然被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已经成为本领域一般技术人员所公知的现有技术。

胶质瘤是临床成人最常见的颅内原发性肿瘤，约占中枢神经系统原发性肿瘤的一半，年发病率约为3～6.4/10万。根据世界卫生组织(WHO)病理分级，胶质瘤分为I～IV级，其中恶性程度最高的多形性母细胞瘤(Glioblastoma multiforme，WHO IV)，具有侵袭性高、异质性大、临床进展快等特点，预后极差。尽管过去几十年中胶质瘤治疗取得了一定进展，但是目前胶质瘤患者经过手术、放疗和化疗的标准方案治疗后，中位生存时间仍然只有14～16个月。胶质瘤的恶性进展是涉及多因素紊乱、多基因调控、多种信号通路介导的复杂病理学过程。因此，揭示胶质瘤发生发展的潜在机制并寻找新的靶向治疗策略至关重要。

可变剪接是真核生物中受到严格调控的生物学过程，一个mRNA前体(pre-mRNA)的蛋白编码序列(外显子)可以被选择性地组装为不同形式，最终产生多种具有独特功能的蛋白亚型。可变剪接失调是肿瘤的重要特征之一，多项研究证实异常剪接产物可参与调控胶质瘤的发生发展。肿瘤相关的可变剪接主要由剪接因子异常表达或活性改变导致，在癌症发生、发展、转移的各个阶段均发挥重要的驱动作用。作为hnRNP家族的成员，多聚嘧啶区结合蛋白1(Polypyrimidine tract binding protein 1，PTBP1)在多种肿瘤中高表达，可通过调节肿瘤特异性的可变剪接事件，促进肿瘤的多种恶性生物学效应，包括细胞增殖、血管生成、侵袭、凋亡、糖酵解代谢、化疗耐药等。这些发现具有重要意义，提示PTBP1介导的异常可变剪接事件有望成为癌症治疗的新兴靶点。然而，目前胶质瘤中PTBP1异常表达或活性改变的调控机制仍不明确。

长链非编码RNA((long noncoding RNA，lncRNA)作为一类新兴的表观遗传调控因子，具有二级结构复杂，功能调控多样等特点。lncRNA通过互补碱基形成复杂、保守的二级结构，可与DNA、RNA或蛋白质相互结合，在染色质重构、转录或转录后水平调控基因的表达。越来越多的研究表明lncRNA与肿瘤发生发展的多种病理进程密切相关，这意味着lncRNA可能在胶质瘤相关的异常可变剪接调控方面也发挥着重要作用，但是发明人发现，相关研究仍比较匮乏，特别是在PTBP1介导的异常剪接事件发生中，大多数lncRNA的功能和生物学效应仍未可知。

发明内容

针对上述现有技术的不足，发明人经长期的技术与实践探索，提供lncRNA LINREP在胶质瘤诊断、预后和治疗中的应用。本发明首次筛选出在胶质瘤/瘤旁/正常脑组织中差异表达同时与PTBP1特异性结合的新型lncRNA LINREP。且证明其是胶质瘤患者的不良预后因素。同时进一步确定了LINREP通过抑制PTBP1的泛素-蛋白酶体降解途径增强PTBP1蛋白稳定性，从而促进PTBP1介导的RTN4 3号外显子跳跃突变的分子调控机制，并从m⁶A甲基化修饰角度探究胶质瘤中LINREP异常表达的上游调控机制。本发明对LINREP在胶质瘤中的临床价值、生物学功能及分子机制进行了深入探索，有望开发其作为脑胶质瘤诊断/治疗/预后标志物的应用。