[发明专利]一种单细胞转录组数据分析方法、装置及电子设备

权利要求书

1.一种单细胞转录组数据分析方法，其特征在于，应用于数据分析平台，所述数据分析平台预先集成多种可视化上游分析工具以及可视化下游分析工具；所述方法包括：

当接收到数据分析请求，从目标数据库中读取目标基因表达谱，所述目标基因表达谱包括利用所述可视化上游分析工具进行上游分析后得到的基因表达谱；

对读取到的所述目标基因表达谱进行预处理得到对应的高可变基因集；

响应于接收到用户对所述高可变基因集对应的基因特征的选择操作，获取用于进行下游分析的高可变基因子集；

对所述高可变基因子集进行降维与压缩处理并利用所述可视化下游分析工具中的任意一种或多种下游分析工具进行下游分析。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述当接收到数据分析请求，从目标数据库中读取目标基因表达谱之前，所述方法还包括：

获取单细胞转录组数据；

利用预设质控方法对所述单细胞转录组数据进行格式转换处理并将格式转换处理后的单细胞转录组数据进行解复用处理得到包含有目标信息的单细胞转录组数据；

将所述包含有目标信息的单细胞转录组数据与参考基因数据进行比对并根据比对结果进行基因表达量的量化处理；

响应于接收到用户对所述可视化上游分析工具中任意一种或多种上游分析工具的选择操作，利用相应的上游分析工具进行上游分析得到所述目标基因表达谱并将所述目标基因表达谱进行格式转换后存储到目标数据库。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对读取到的所述目标基因表达谱进行预处理得到对应的高可变基因集，包括：

对所述目标基因表达谱进行质控处理并将质控处理后的目标基因表达谱进行归一化处理；

对归一化处理后的目标基因表达谱进行缩放处理后得到所述高可变基因集。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：

若所述目标基因表达谱包括多个批次数据，分别对每一个批次数据进行高可变基因子集的获取以及降维和压缩处理；

将每一个批次数据对应的处理结果进行整合处理；

利用选择的可视化下游分析工具对所述整合处理后的数据进行下游分析。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述数据分析平台的框架包括Nextflow框架和Flask框架。

6.一种单细胞转录组数据分析装置，其特征在于，应用于数据分析平台，所述数据分析平台预先集成多种可视化上游分析工具以及可视化下游分析工具；所述装置包括：

读取模块，用于当接收到数据分析请求，从目标数据库中读取目标基因表达谱，所述目标基因表达谱包括利用所述可视化上游分析工具进行上游分析后得到的基因表达谱；

第一处理模块，用于对读取到的所述目标基因表达谱进行预处理得到对应的高可变基因集；

第一获取模块，用于响应于接收到用户对所述高可变基因集对应的基因特征的选择操作，获取用于进行下游分析的高可变基因子集；

第一分析模块，用于对所述高可变基因子集进行降维与压缩处理并利用所述可视化下游分析工具中的任意一种或多种下游分析工具进行下游分析。

7.根据权利要求6所述的装置，其特征在于，所述装置还包括：

第二获取模块，用于获取单细胞转录组数据；

第二处理模块，用于利用预设质控方法对所述单细胞转录组数据进行格式转换处理并将格式转换处理后的单细胞转录组数据进行解复用处理得到包含有目标信息的单细胞转录组数据；

第三处理模块，用于将所述包含有目标信息的单细胞转录组数据与参考基因数据进行比对并根据比对结果进行基因表达量的量化处理；

第二分析模块，用于响应于接收到用户对所述可视化上游分析工具中任意一种或多种上游分析工具的选择操作，利用相应的上游分析工具进行上游分析得到所述目标基因表达谱并将所述目标基因表达谱进行格式转换后存储到目标数据库。

8.根据权利要求6所述的装置，其特征在于，所述数据分析平台的框架包括Nextflow框架和Flask框架。