[发明专利]一种用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法和装置在审

专利信息
申请号: 202210929570.3 申请日: 2022-08-03
公开(公告)号: CN115171795A 公开(公告)日: 2022-10-11
发明(设计)人: 焦阳;吴俊峰;潘麓蓉 申请(专利权)人: 慧壹科技(上海)有限公司;香港圆壹智慧有限公司;美国圆壹智慧科技有限公司
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30;G16B15/30;G16B40/00
代理公司: 北京清大紫荆知识产权代理有限公司 11718 代理人: 黄贞君;黎飞鸿
地址: 201316 上海市浦东新区中国(上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 药物 相互作用 数据 清洗 方法 装置
【权利要求书】:

1.一种用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,包括如下步骤:

提供原始的药物-靶点相互作用数据集合;

对所述原始的药物-靶点相互作用数据集合根据预定的清洗规则进行筛选过滤,获得待研究的药物-靶点相互作用数据集合;

其中,所述预定的清洗规则基于图的邻接矩阵的数据结构。

2.如权利要求1所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,所述预定的清洗规则包括:

步骤1:构建通用数据结构;

步骤2:选取所述通用数据结构中的子集数据结构,所述子集数据结构包括所述原始的药物-靶点相互作用数据集合的数据结构;

步骤3:将所述子集数据结构转化为基于所述图的邻接矩阵的数据结构;

步骤4:基于所述图的邻接矩阵的数据结构完成数据清洗。

3.如权利要求1所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,

基于所述图的邻接矩阵的数据结构,进行逻辑关系的补完或距离计算。

4.如权利要求1所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,

所述图的邻接矩阵的数据结构的存储方式采用按行记录的稀疏矩阵。

5.如权利要求1所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,

所述图的邻接矩阵的数据结构中,使得在同一个所述图的邻接矩阵中存储多种关系。

6.如权利要求5所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗方法,其特征在于,

所述图的邻接矩阵的数据结构中,采用二进制转为整数值的flag值的方式存储,使得在同一个所述图的邻接矩阵中存储多种关系。

7.一种用于药物-靶点相互作用数据的清洗装置,其特征在于,包括:

数据提供单元,设置为提供原始的药物-靶点相互作用数据集合;

数据清洗单元,设置为对所述原始的药物-靶点相互作用数据集合根据预定的清洗规则进行筛选过滤,获得待研究的药物-靶点相互作用数据集合;

其中,所述预定的清洗规则基于图的邻接矩阵的数据结构。

8.如权利要求7所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗装置,其特征在于,

所述预定的清洗规则包括:

步骤1:构建通用数据结构;

步骤2:选取所述通用数据结构中的子集数据结构,所述子集数据结构包括所述原始的药物-靶点相互作用数据集合的数据结构;

步骤3:将所述子集数据结构转化为基于所述图的邻接矩阵的数据结构;

步骤4:基于所述图的邻接矩阵的数据结构完成数据清洗。

9.如权利要求7所述的用于药物-靶点相互作用数据的清洗装置,其特征在于,

所述数据清洗单元中,所述预定的清洗规则还包括,基于所述图的邻接矩阵的数据结构,进行逻辑关系的补完或距离计算。

10.一种电子设备,其特征在于,包括:存储器、处理器;其中,所述存储器用于存储一条或多条计算机指令,其中,所述一条或多条计算机指令被所述处理器执行时实现如权利要求1-6中任意一项所述的药物-靶点相互作用数据的清洗方法。

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