[发明专利]一种与鸡肤色和屠体性状相关的CDK5基因分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种与鸡肤色和屠体性状相关的CDK5基因分子标记及应用，属于生物技术领域。所述分子标记位于鸡CDK5基因上，所述CDK5基因的登录号为GeneID:100190948，所述分子标记具体为如SEQIDNO:1所示序列存在NC_052533.1：g318206CT，NC_052533.1：g318251CT，NC_052533.1：g318256CT，NC_052533.1：g318338CT。上述4个分子标记与鸡的肤色和屠体性状呈显著相关，可以准确鉴定鸡肤色和屠体性状，为分子标记辅助选择育种提供新的SNP分子标记，从而为鸡的选育提供科学依据。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种与鸡肤色和屠体性状相关的CDK5基因分子标记及应用。

背景技术

鸡作为最重要的农业畜禽动物之一，其产肉性能直接影响着市场经济效益。屠体性状是动物生产中重要的经济性状，直接反应动物的产肉性能，如屠体重、半净膛重、全净膛重、腿肌重、胸肌重及翅重等，因此一直是动物育种生产中的研究热点。在肉质品质的基础上，进一步提高肉鸡的屠体重是肉鸡选育的目标。同时，家禽皮肤颜色大多呈现黄色，其呈色物质为类胡萝卜素和叶黄素。随着生活水平的提高，消费者更倾向于选择表皮颜色较黄、皮肤色泽较亮、色度均匀的鸡肉。目前关于鸡肤色研究的实际应用大多停留在营养调控水平，对于基因调控和分子标记相关的研究仍处在不断地探索和验证阶段，如何培育出高黄、颜色均匀和稳定的鸡，使鸡的皮肤颜色满足于消费者选择的需求，也是一个育种技术难点。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指基因组水平上由单个核苷酸的插入、缺失、颠换和转换等而引起的基因组DNA序列的多态性。SNP是动物可遗传变异中最常见的一种，在动物基因组中广泛存在，具有稳定遗传，易于检测等特性。在动物生产实践中，SNP可用于分子标记辅助选择(Molecular Mark-assist Selection,MAS)从而突破传统育种的瓶颈来提高选种的准确性和目标性状的选育效果。

细胞周期素依赖蛋白激酶5(Cyclin—dependent Kinase 5，CDK5)是由脯氨酸引导的丝氨酸/苏氨酸激酶，最新的研究表明CDK5在线粒体中具有重要功能，与线粒体编码蛋白的互作极显著地影响线粒体功能的正常表达。线粒体作为细胞的能量代谢中心，在肌肉生长发育和色素沉积中等过程生理过程中扮演着重要角色。据报道，CDK5基因能够干预羊驼黑色素细胞形成，同时还能够参与羊驼毛色的形成。不同物种CDK5基因编码区的生物信息差异较大。该基因在鸟类中的具体作用少有报道，尤其是在鸡上的研究更少。

发明内容

本发明的目的是提供一种与鸡肤色和屠体性状相关的CDK5基因分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题。该分子标记可以准确鉴定鸡肤色和屠体性状，为MAS提供新的SNP分子标记，从而为鸡的选育提供科学依据。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与鸡肤色和屠体性状相关的分子标记，所述分子标记位于鸡CDK5基因上，所述CDK5基因的登录号为GeneID:100190948，所述分子标记包括SNP1-SNP4，其中，SNP1为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318206CT；SNP2为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318251CT；SNP3为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318256CT；SNP4为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318338CT。

进一步地，SNP1存在基因型CC、CT和TT；SNP2存在基因型CC、CT和TT；SNP3存在基因型CC、CT和TT；SNP4存在基因型CC、CT和TT。

本发明还提供一种根据所述的分子标记鉴别鸡肤色和屠体性状的方法，包括以下步骤：

(1)以待测鸡基因组DNA为模板，利用引物扩增包括所述分子标记的基因片段，获取扩增产物；