[发明专利]基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法在审

专利信息
申请号: 202210957369.6 申请日: 2022-08-10
公开(公告)号: CN115359923A 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 陈美华;郭进建;黄飞翔;欧阳秋芳;严萍;陈飞;倪志坚;严锦贤;游涛;叶盈;谢胜伟;王永 申请(专利权)人: 福建中医药大学附属第二人民医院(福建省第二人民医院)
主分类号: G16H70/40 分类号: G16H70/40;G16H70/60;G16B15/30
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 田立媛
地址: 350003 福*** 国省代码: 福建;35
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 基于 网络 药理学 分析 心力衰竭 治疗 药物 作用 方法
【权利要求书】:

1.基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)分别对心力衰竭治疗药物的成分进行检索筛选,获得潜在活性成分;根据潜在活性成分筛选药物靶点;所述心力衰竭治疗药物包括白术、丹参、桂枝、红参、黄芪、蒲黄、葶苈子和猪苓;

(2)检索心力衰竭疾病作用靶点;

(3)药物靶点与疾病作用靶点取交集,获得药物-疾病共同靶点;

(4)根据潜在活性成分与药物-疾病共同靶点构建药物-成分-靶点-疾病网络,通过与药物-疾病共同靶点的关联个数进行潜在活性成分排序,分析核心成分;

(5)根据药物-疾病共同靶点构建蛋白相互作用的PPI网络,根据PPI网络进行拓扑分析或聚类分析,筛选核心靶点;

(6)根据药物-疾病共同靶点进行关键靶基因GO富集分析与KEGG富集分析;

(7)动物实验验证。

2.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(1)中,

在TCMSP数据库中设定OB≥30%、DL≥0.136,对白术、丹参、桂枝、红参、黄芪、蒲黄、葶苈子、猪苓的成分进行筛选,使用Pumchem数据库获得各成分的SDF结构,导入Swiss TargetPrediction数据库筛选药物靶点。

3.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(2)中,

使用OMIM、Genecards数据库以“heart failure”为关键词进行检索,获得疾病作用靶点。

4.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(3)中,

根据药物靶点与疾病作用靶点绘制韦恩图,取交集,获得药物-疾病共同靶点。

5.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(4)中,

根据潜在活性成分与药物-疾病共同靶点,使用Cytoscape软件,构建药物-成分-靶点-疾病网络;

使用NetworkAnalyzer对构建的药物-成分-靶点-疾病网络进行拓扑分析,通过与药物-疾病共同靶点的关联个数进行潜在活性成分排序,分析核心成分。

6.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(5)中,

利用STRING数据库检索药物-疾病共同靶点,设置蛋白种类为“Homo sapiens”,最低相互作用阈值为0.4,构建蛋白相互作用的PPI网络。

7.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(5)中,

利用STRING数据库检索药物-疾病共同靶点,设置蛋白种类为“Homo sapiens”,最低相互作用阈值为0.4,获取靶点相互作用的网络关系数据;

将靶点相互作用的网络关系数据导入Cytoscape软件,构建蛋白相互作用的PPI网络。

8.根据权利要求6或7所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(5)中,

将PPI网络导入Cytoscape中,通过NetworkAnalyzer工具进行拓扑分析,选取degree值大于平均分的基因作为核心靶点;

或将已经构建好的PPI网络导入Cytoscape中,使用MCODE模块进行基因簇的分析以及核心靶点的筛选。

9.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析心力衰竭治疗药物作用靶点的方法,其特征在于,

步骤(6)中,

基于R软件使用Bioconductor生物信息软件包以Pvalue0.05,Q value0.05进行GO富集分析与KEGG富集分析。

10.根据权利要求1-9任一项所述方法筛选获得的核心靶点在心力衰竭治疗药物筛选、分析、验证中的应用。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于福建中医药大学附属第二人民医院(福建省第二人民医院),未经福建中医药大学附属第二人民医院(福建省第二人民医院)许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202210957369.6/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top