[发明专利]一种肠道微生物相关代谢物质谱数据库的构建方法及其应用有效
申请号: | 202211012492.7 | 申请日: | 2022-08-23 |
公开(公告)号: | CN115083528B | 公开(公告)日: | 2023-01-24 |
发明(设计)人: | 成晓亮;余静;周岳;张伟;郑可嘉 | 申请(专利权)人: | 南京品生医疗科技有限公司;上海氨探生物科技有限公司;江苏品生医疗科技集团有限公司 |
主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G16B35/00 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 陈小龙 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区智*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肠道 微生物 相关 代谢 物质 数据库 构建 方法 及其 应用 | ||
1.一种肠道微生物相关代谢物质谱数据库,其特征在于,所述肠道微生物相关代谢物质谱数据库包含了405种代谢物,其中包含代谢物的名称、保留时间、分子式、母离子及碎片离子精确质量信息、类别、HMDB ID、KEGG ID和同位素丰度比;
所述肠道微生物相关代谢物质谱数据库由包括如下步骤的肠道微生物相关代谢物质谱数据库的构建方法建立得到;
(1)收集肠道微生物相关代谢物的标准品,将基本信息录入建库系统;
(2)将肠道微生物相关代谢物标准品进样至色谱质谱联用仪中,进行色谱洗脱检测与质谱检测,采集得到保留时间及谱图信息;
所述进样是指将标准品与溶剂混合得到标准品溶液,进行进样,所述溶剂包括甲醇、异丙醇或二甲基亚砜中的任意一种或至少两种的组合,所述标准品溶液的浓度为2-5 mg/mL,根据标准品的极性情况,选择不同的模式进行色谱洗脱检测,常规极性代谢物的标准品采用常规极性模式进行检测,强极性代谢物的标准品采用强极性模式进行检测,所述常规极性模式中,所用色谱柱包括BEH C18柱,所述强极性模式中,所用色谱柱包括BEH Amide柱,所述质谱检测中,质谱参数中的NCE设置为6个窗口,分别为10、20、30、40、50和60,所述色谱质谱联用仪为Q Exactive组合型四极杆Orbitrap质谱仪;
(3)将采集到的保留时间及谱图信息导入建库系统,整合信息,构建得到所述肠道微生物相关代谢物质谱数据库。
2.一种检测生物样本中的肠道微生物相关代谢物的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(a)将生物样本与提取试剂混合,提取得到生物样本中的代谢物;
(b)将提取到的代谢物进样至色谱质谱联用仪中,进行色谱洗脱检测与质谱检测,采集得到数据;
(c)将数据导入搜库软件中进行搜库,并与权利要求1所述的肠道微生物相关代谢物质谱数据库中的信息进行匹配,根据匹配程度,得到生物样本中的肠道微生物相关代谢物的鉴定结果。
3.如权利要求2所述的检测生物样本中的肠道微生物相关代谢物的方法,其特征在于,所述生物样本包括血浆、血清、尿液、粪便、脑脊液、唾液或组织中的任意一种。
4.如权利要求2或3所述的检测生物样本中的肠道微生物相关代谢物的方法,其特征在于,所述色谱洗脱检测包括两次检测:分别为在常规极性模式与强极性模式下进行检测,检测条件与权利要求1中所述的构建方法中所用的检测条件保持一致。
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