[发明专利]检测木瓜秀粉蚧LGMN基因转录水平的引物及方法在审
申请号: | 202211033360.2 | 申请日: | 2022-08-26 |
公开(公告)号: | CN115992253A | 公开(公告)日: | 2023-04-21 |
发明(设计)人: | 赵建伟;傅建炜;李建宇;郑丽祯;陈燕婷;史梦竹 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 林文弘;蔡学俊 |
地址: | 350013 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 木瓜 秀粉蚧 lgmn 基因 转录 水平 引物 方法 | ||
1.一种检测木瓜秀粉蚧LGMN基因转录水平的荧光定量PCR引物,其特征在于:包括符合荧光定量PCR反应特点的上下游引物:
LGMN-F:5`- GCTACCATATCCTCCACCAC-3`,
LGMN-R:5`- TTTTCTCTTCAGCATTCAAC-3`。
2.一种采用权利要求1所述的荧光定量PCR引物检测木瓜秀粉蚧LGMN基因转录水平的荧光定量PCR方法,其特征在于:按如下步骤:
(1)cDNA第一链合成:提取样本的总RNA并纯化,采用反转录试剂盒得到以提取的RNA为模板反转录得到的cDNA;
(2)以下述引物进行常规PCR检测:
木瓜秀粉蚧LGMN基因的荧光定量上下游引物:
LGMN-F:5`- GCTACCATATCCTCCACCAC-3`,
LGMN-R:5`- TTTTCTCTTCAGCATTCAAC-3`;
内参基因Tubulin的上下游引物:
Tubulin-F: 5`-CTTCACTTCTTCATGCCTGG-3`,
Tubulin-R: 5`-TTTGTTCGTCAACTTCTTTC-3`;
常规PCR扩增体系总体积为20µL:2X Taq Plus Master Mix 10µL,5uM上游引物0.8µL,5uM下游引物0.8µL,100ng/µL cDNA模板1.0µL,水7.4µL;
常规PCR反应程序为:94℃预变性5 min,然后95℃变性30 s, 50℃退火30 s, 72℃延伸1 min,此条件下35个循环,最后72℃再延伸10min;
(3)实时荧光定量PCR反应:
以步骤(1)得到的cDNA为模板,加入步骤(2)所述的引物,进行荧光定量PCR反应,每个样品设置3个重复,扩增后取平均值;
实时荧光定量PCR扩增体系为:2X ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix 10µL,5uM上游引物0.8µL,5uM下游引物0.8µL,50 X ROX Reference Dye 2 0.4µL,100 ng/µL cDNA2.0µL,补足水至20µL;
实时荧光定量PCR反应程序为:95℃预变性5 min,然后95℃变性5 s 、50℃退火30 s、72℃延伸40 s,40个循环。
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