[发明专利]基因启动子区甲基化水平检测试剂在制备ccRCC预后试剂中的应用及试剂盒

说明书

本发明涉及涉及基因启动子区甲基化水平检测试剂在制备ccRCC预后试剂中的应用。在一个具体实施方案中，所述基因启动子区甲基化水平检测试剂为检测以下位点的甲基化水平的检测试剂：cg13965612、cg00869668、cg03933495、cg23067082、cg06303238、cg21655830、cg03021802、cg06941557、cg25598840、cg01286935、cg23462514、cg17367832、cg06577005、cg18210365、cg17868751、cg14947429、cg24332577、cg26728517。本发明通过构建出一个优于当前所有预后方法的针对ccRCC的预后模型，医生可根据该预后模型指示的风险评分为患者提供最适的治疗手段。

技术领域

本发明涉及ccRCC的诊断与预后领域，更特别的，涉及基因启动子区甲基化水平检测试剂在制备ccRCC预后试剂中的应用。

背景技术

肾透明细胞癌(ccRCC)是一种常见的肾细胞癌，占据了肾细胞癌的 80％-90％，具有较高的复发率、转移率及死亡率。ccRCC是一种高度异质的肿瘤，具有从缓慢生长的局部肿瘤到向远处转移的侵袭性肿瘤等复杂多变的临床表现。

目前，ccRCC的预后分析方法包括TNM分级、UISS评分、SSIGN评分以及Leibovich评分，然而这些分级和评分在很大程度上依赖于病理学家的经验与主观判断。

ccRCC术后患者的预后判断仍主要基于TNM分期。欧洲泌尿外科协会 (EAU)指南指出，术后预测系统、诺模图(Nomogram)可能较常规的TNM 分期、Fuhrman分级对预后的预测更加准确。既往有一些ccRCC预后相关的 Nomogram研究，但多数只纳入传统的临床信息，如肿瘤分期、分级等变量，并且仅关注模型的准确性，较少关注临床获益，从而无法全面评估模型的临床应用价值。

Nomogram作为一种可视化的、具有临床应用价值的医学预测模型，可以提供更加准确且个性化的预后评估。Nomogram可以客观评估新的预测变量。研究认为临床症状与ccRCC患者预后有关，此结论在既往研究中存在争议，这可能是因为病情较轻的患者往往无明显的临床症状。

既往有研究建立Nomogram来评估RCC患者预后，其中Karakiewicz PI 等的Nomogram较为经典且广为引用。研究用于评估RCC患者术后的肿瘤特异性生存，其研究纳入2474例患者，经单因素和多因素Cox回归分析后，最终的Nomogram包括了肿瘤分期、Fuhrman分级、肿瘤大小和临床症状，预测准确性为89％。但该研究纳入变量较少，只分析传统的肿瘤学特征，并未纳人其他可能与预后有关的变量。Yaycioglu O等研究非转移性RCC患者的无复发生存情况，发现年龄、性别、存在放射性淋巴结、临床症状、肿瘤大小和临床分期是预后相关预测因子，其最终构建的Nomogram的CI为0.747。

随着分子生物学技术的发展，越来越多的分子标记被用于疾病的诊断和预后。但是，对于ccRCC而言，还缺少了足够的差异甲基化位点，未能构建出有效的预后模型。因此，需要找到更多与ccRCC预后有关的分子标记，用来构建更可靠的ccRCC的预后模型。

发明内容

我们在研究中开发由18个差异甲基化位点构成的风险评分模型，并找出了高风险与低风险患者之间的风险评分切值，运用该风险评分模型和切值，可对ccRCC患者的治疗和进展前景进行有效而准确的预测，优于当前所有关于ccRCC的预后方法。

基于以上工作，本发明提供了基因启动子区甲基化水平检测试剂在制备 ccRCC预后试剂中的应用。