[发明专利]一组结肠癌DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用

说明书

本发明公开了一组结肠癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用。所述的标志物是30个结肠癌甲基化特异性的CpG位点。这30个CpG位点包括cg06668555、cg06392169、cg18596362、cg13265789、cg21782409、cg04555373、cg01893212、cg04904331、cg12584684、cg04454951、cg04804539、cg20078466、cg09493505、cg05470523、cg19202058、cg00333226、cg15701178、cg01194057、cg01610488、cg07039180、cg04279973、cg06716730、cg18500968、cg03462053、cg05000488、cg14898779、cg14018648、cg19981409、cg05407490和cg0533134，分布在16个不同基因上：FAM135B、IRF4、CBLN2、UNC5C、NRG1、VWC2、MAL、IKZF1、TRPA1、PRKCB、DUSP14、TMPRSS3、KRT6A、STK31、ASGR1和NOX4。其中，有9个基因与结肠癌患者的生存率明显相关，可用于制备结肠癌预后判断试剂盒。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的方法。本发明的DNA甲基化分子标志物具有良好的诊断指标特性，可以有效用于结肠癌诊断和预后，具有较高的临床使用和推广价值。

技术领域

本发明涉及生物检测技术领域，具体涉及一组结肠癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌诊断试剂盒中的应用。

背景技术

结肠癌疾病的确切原因尚不清楚，然而，一些特定的危险因素与结肠癌高度相关，包括不健康饮食、大量饮酒和吸烟。此外，有结肠癌家族史或有某些遗传性癌症综合征的人患此病的风险很高。细胞中的基因突变是结肠癌最常见的原因之一。由于缺乏有效的诊断方法，结肠癌在早期是不容易被发现的。

尽管已经有一些关于结肠癌的分子探索、生物标志物和治疗靶点，这些对治疗和诊断这种疾病有很大的贡献，但由于生物的复杂性和较大的肿瘤个体差异性，目前急需具有更高稳定性和准确性的结肠癌标志物。

DNA甲基化是一种在基因调控中起重要作用的表观遗传标志物。异常的DNA甲基化修饰与许多疾病有关。并且，甲基化标志物比蛋白质标志物更稳定，这明确了癌症特异性甲基化标志物具有巨大的潜力，可用于在临床上准确诊断癌症。但是，目前关于甲基化标志物在结肠癌中的应用较少，大多数找到的甲基化标志物均为特定基因中的启动子或差异甲基化区域，这让检测过程复杂、检测的成本也较高。

发明内容

本发明的目的在于通过甲基化测序数据和RNA-seq测序数据的整合分析，进一步结合机器学习方法，提供一组结肠癌DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用。本发明选择结肠癌DNA甲基化标志物的原则是：尽可能选出最具有标志性的位点，以降低检测的复杂性和实验成本。