[发明专利]一种未分化脊柱关节病的肠型评分模型及构建方法和应用在审

专利信息
申请号: 202211111708.5 申请日: 2022-09-13
公开(公告)号: CN115662505A 公开(公告)日: 2023-01-31
发明(设计)人: 王琪;贺培凤;张升校;乔军;程婷;王灿;常敏静;张一凡;宋珊;赵蓉 申请(专利权)人: 山西医科大学
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B40/00;G16B40/30;G06F18/2135
代理公司: 太原申立德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14115 代理人: 王芳
地址: 030000 *** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: 一种 分化 脊柱 关节 评分 模型 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种未分化脊柱关节病的肠型评分模型,其特征在于:通过挖掘uSpA样本肠道菌群的特征,采用Dirichlet多项式混合无监督聚类描述微生物组数据的变异性,对uSpA肠道菌群分型为E1型和E2型;以LDA SCORE log10>2为界,通过LEfSe筛选出不同肠型间基于属水平的肠道微生物分类标志物;通过主成分分析PCA,分别提取两个肠型各优势菌的主成分PC1作为分类标志物的特征评分PC1i和PC1j,构建肠型的评分,具体计算公式如下:

肠型评分=∑PC1i-∑PC1j

所述E1型的特征性菌为:土杆菌、GCA_900066575菌、毛螺菌科\FCS020\菌、瘤胃球菌、毛螺菌科\UCG\001菌、真杆菌科\腹菌、粪球菌、真杆菌\木霉菌、颤螺菌、嗜胆汁菌、毛螺菌科\UCG\003菌、CAG\56菌、毛螺菌科\UCG\010菌、科林塞拉、单球状体、副甾体、多莉娅、真杆菌群、脱硫弧菌、UCG\003菌、毛螺菌科\ND3007\菌、丁基橡胶、真杆菌科\锡雷乌姆菌、臭细菌、RF39菌、伦布西亚、NK4A214\组、丹毒菌科UCG\003菌、阿克曼西亚、副卡特尼菌、巴内西拉、真杆菌反刍动物菌、UCG\005菌、CAG\352菌、杆菌\埃希菌、粪球菌、无杆菌、菊科\R\7\菌、毛螺菌科\NK4A136\菌、UCG\010、蔷薇属、UCG\002菌、拨号器菌、瘤胃球菌、下穹窿、真杆菌\共前列烷烯菌、梭状芽孢杆菌UCG\014、阿利斯蒂普斯、普雷沃菌属、粪杆菌;

E2型的特征性菌为:类杆菌、大肠杆菌志贺氏菌、腔隙杆菌、瘤胃球菌\gnavus菌、韦荣氏球菌属、梭杆菌、肠球菌、相位弧菌、梭菌群、哈夫尼亚菌、拉赫诺斯皮拉、黄酮萃取菌、丹毒杆菌、梭状芽孢杆菌、共右旋杆菌、萨特氏菌、艰难梭菌、亨加泰拉。

2.根据权利要求1所示的一种未分化脊柱关节病的肠型评分模型用于肠道微生物判别。

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