[发明专利]一种用于猪接种猪圆环病毒疫苗后提高其抗体产生的SNP标记

说明书

本发明提供了用于猪接种猪圆环病毒疫苗后提高其抗体产生的SNP标记。所述SNP标记位于SEQ ID No.1上的从5’端起的第501位点，对应于11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从5’端起的第206702784位点，为G或A。

技术领域

本发明提供了一种用于猪接种猪圆环病毒疫苗后提高其抗体产生的SNP标记。

背景技术

猪是人类最主要的肉类来源。我国猪肉产量和猪肉消费量世界排名第一，其养殖产业促进我国经济发展。疾病的感染给猪的生存带来巨大的威胁，一旦感染疾病损失惨重。

猪圆环病是由猪圆环病毒引起的相关疾病，包括多系统衰竭综合征、猪皮炎肾病综合征、猪呼吸道疾病综合症。猪是猪圆环病毒的天然宿主，不同年龄、品种、性别的猪都易被感染，且流行范围广，致死率高。主要侵害哺乳仔猪和育肥猪，特别是在初生仔猪身上发生，尤其在断奶后2至8周的仔猪。目前我国养殖企业特别是中小企业依然容易发生猪圆环病毒的感染。

接种疫苗是目前最有效的抗击疾病的手段，但市场上疫苗功效不一及猪场疫苗的滥用，同时不同猪个体对疫苗的免疫应答能力不同，致使无法从根本上解决疾病防控问题。通过选育对疫苗反应强的猪只进行选种繁育成为抵抗疾病最有效方式，但不同于经济性状，猪只对疫苗反应的强弱无法从传统的肉眼识别上进行淘汰育种，猪只一旦感染疾病，其生产性能受到影响，无法作为优良种猪进行繁育。

发明内容

本发明之一提供了一种猪的SNP标记，所述SNP标记位于SEQ ID No.1上的从5’端起的第501位点，对应于11.1版本国际猪基因组的13号染色体上的从5’端起的第206702784位点，为G或A。

本发明之二提供了如本发明之一所述的SNP标记在确定猪对猪圆环病毒疫苗应答产生抗体能力中的应用。

在一个具体实施方式中，所述猪圆环病毒为猪圆环病毒2型。

本发明之三提供了一种猪的遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如本发明之一所述的SNP标记，并根据所述SNP标记做出相应的选择：

在所述种猪核心群中选择在如SEQ ID No.1所示的序列中的从5’端起的第501位点为G/A和G/G基因型的种猪个体，淘汰在该位点为A/A基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因G的频率。

在一个具体实施方式中，在所述种猪核心群中选择在如SEQ ID No.1所示的序列中的从5’端起的第501位点为G/G基因型的种猪个体，淘汰在该位点为G/A和A/A基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因G的频率。

在一个具体实施方式中，利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如本发明之一所述的SNP标记，其中所述核酸的序列如SEQ ID No.1所示。

本发明之四提供了一种猪接种猪圆环病毒疫苗后提高抗体产生的猪新品系和/或猪新品种建立的方法，其包括如下步骤：对于如本发明之一所述SNP标记的基因型为G/A或A/A的猪，通过定点突变将其中的G/A或A/A突变为G/G基因型。

在一个具体实施方式中，利用转基因的方法或基因编辑的方法进行突变。

在一个具体实施方式中，利用CRISPR/Cas9的基因编辑方法进行突变。

在一个具体实施方式中，所述猪圆环病毒为猪圆环病毒2型。

本发明的有益效果：

本发明首次发现与猪接种猪圆环病毒疫苗后提高抗体产生相关的SNP位点，因此可以通过本发明的SNP标记对猪群该位点进行判型，并通过该SNP标记对猪群进行猪接种猪圆环病毒疫苗后提高抗体产生的遗传改良。

附图说明

图1显示了猪圆环病毒疫苗抗体值的全基因组关联分析曼哈顿图及最高位点效应图。