[发明专利]一种湿加松年龄标记基因PtTIFY20及其筛选方法与应用在审
申请号: | 202211155816.2 | 申请日: | 2022-09-22 |
公开(公告)号: | CN115927721A | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 林金星;杨舜垚;张贵芳;张莹莹;张曦;赵媛媛;黄婷;谭志强;邓乐平;林昌明;叶威方;陈秀云;赵美儒;司徒荣贵 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 崔玥 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 湿加松 年龄 标记 基因 pttify20 及其 筛选 方法 应用 | ||
1.一种湿加松年龄标记基因PtTIFY20,其特征在于,所述标记基因PtTIFY20的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.权利要求1所述基因PtTIFY20在判断湿加松年龄中的应用,其特征在于,所述基因PtTIFY20与湿加松年龄呈正相关。
3.权利要求1所述基因PtTIFY20在判断湿加松组织器官的个体发育老化程度中的应用,其特征在于,所述基因PtTIFY20与湿加松组织器官的个体发育老化程度呈正相关。
4.根据权利要求2或3所述的应用,其特征在于,利用引物组分别测定待测样本和参考样本中基因PtTIFY20的表达量,通过比较待测样本和参考样本中基因PtTIFY20的表达量大小判断湿加松年龄或组织器官的个体发育老化程度。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述引物组中上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
6.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述参考样本为与待测样本同龄的实生湿加松最下层的枝条。
7.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述判断的方法为:若被测样本中PtTIFY20基因的表达量与参考样本中无显著差异,则被测样本的年龄或组织器官的个体发育老化程度与目标年龄或组织器官的个体发育老化程度大致相同;若被测样本中PtTIFY20基因的表达量显著低于参考样本,则被测样本年龄或组织器官的个体发育老化程度低于目标年龄或组织器官的个体发育老化程度;若被测样本中PtTIFY20基因的表达量显著高于参考样本,则被测样本年龄或组织器官的个体发育老化程度高于目标年龄或组织器官的个体发育老化程度。
8.一种权利要求1所述湿加松年龄标记基因PtTIFY20的筛选方法,其特征在于,所述筛选方法包括如下步骤:
以不同树龄的实生湿加松作为样本材料,经RNA提取、文库构建、转录组测序获得不同树龄实生湿加松的基因数据;
对所得的基因数据依次进行数据质控、参考基因组比对、基因表达量分析和加权基因共表达网络分析后即得所述湿加松年龄标记基因PtTIFY20。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述样本材料为实生湿加松最低冠层的末梢枝条。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述树龄包括0.5年、2年、4年、6.5年和10年。
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