[发明专利]大白菜显性桔红色基因BrOr的KASP标记及其应用

说明书

本发明涉及了大白菜显性桔红色基因BrOr的KASP标记及其应用，通过BSA‑seq(bulked segregant analysis sequencing)方法定位到一个新的显性桔红色基因BrOr；首次公开了显性桔红色基因BrOr的SNP标记A09‑4063965及其检测引物BrOr‑KASP1，该检测引物包含三条引物；通过对遗传群体的DNA进行PCR扩增，并利用KASP基因分析系统检测，发现BrOr‑KASP1可明显区分桔红色和白色材料，可用于桔红色白菜类蔬菜新品种的选育。

技术领域

本发明涉及作物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种大白菜显性桔红色基因BrOr的高通量检测标记及其在育种中的应用

背景技术

大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)是原产于我国的一种十字花科重要蔬菜作物。其心叶通常呈白色、黄色，目前市面上也有一些新选育的桔红心大白菜。与白色心叶相比，桔红色心叶白菜积累的类胡萝卜素更多。类胡萝卜素是一类重要的天然色素的总称，是由8个异戊二烯单位首尾相连形成的四萜化合物，在人类营养和健康方面也发挥着重要的作用，既是体内维生素A的主要来源，同时还具有抗氧化、免疫调节、抗癌、延缓衰老等功效。由于桔红心大白菜颜色艳丽、营养丰富、新颖性强等受到了消费者的喜爱，因此桔红心大白菜品种是重要的品种选育方向之一。

目前在选育桔红色大白菜过程中仍是通过传统的育种手段，费时费力，极大的延缓了育种进程。利用分子标记可加快品种的选育，然而已知桔红心基因CRTISO为隐性单基因控制，不能在育种中很好的应用。此外，国内外关于白菜桔红心性状缺乏具有应用价值的分子标记，限制了其在分子育种中的应用。使用与桔红心基因紧密连锁的分子标记，在苗期就可对植株抗性进行筛选与鉴定，提高材料鉴定效率，有效缩短桔红心品种的培育年限。因此，开发大白菜桔红心连锁分子标记，对桔红心品种的培育具有重要的应用价值。

发明内容

本发明的第一个方面提供一种大白菜显性桔红色基因BrOr，其特征在于，该基因位于A09染色体1.42-12.19Mb区间内，BraA09g007080.3C(A09：4062751–4064398Mb)，在红色心叶品种中，A09染色体的569bp位置存在一个4670bp的插入，而在白色心叶品种中并不存在。

本发明的第二个方面是提供上述的基因在白菜育种中的应用，其特征在于用于培育球心为桔红色心叶白菜品种或是白色心叶品种。

本发明的第三个方面提供一种用于鉴定白菜显性桔红色基因BrOr的InDel标记A09-4063965的引物组，其中包括BrOr-KASP1Fa、BrOr-KASP1Fb、BrOr-KASP1R，其序列分别为SEQ ID NO:1-3所示。

本发明的第四个方面提供一种用于鉴定白菜显性桔红色基因BrOr的InDel标记A09-4063965的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包括了上述的引物组。在另外一个具体的实施例中，所述的试剂盒还包括KASP-PCR所需要的试剂。

本发明的第五个方面是提供上述的引物组在鉴定白菜显性桔红色基因BrOr的InDel标记A09-4063965中的应用。

本发明的第六个方面是提供所述的引物组在辅助白菜育种中的应用。

本发明的第七个方面是提供上述包含引物组的试剂盒在鉴定白菜显性桔红色基因BrOr的InDel标记A09-4063965中的应用。

本发明的第八个方面是提供上述包含所述引物组的试剂盒在辅助白菜育种中的应用。

与现有技术相比，本发明的优点在于：