[发明专利]用于检测大丽轮枝菌的引物组合、试剂盒及应用在审
申请号: | 202211203289.8 | 申请日: | 2022-09-29 |
公开(公告)号: | CN116064905A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 王永林;陈琦;唐晨;黄建东 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学;北京昌回林海生态科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 李正 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 大丽轮枝菌 引物 组合 试剂盒 应用 | ||
1.用于检测大丽轮枝菌的引物组合,其特征在于,所述引物组合包括RPA引物对和crRNA;所述RPA引物对的靶标基因包括大丽轮枝菌ITS基因;所述crRNA的靶标基因包括大丽轮枝菌ITS基因。
2.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述RPA引物对包括上游引物和下游引物;所述上游引物的序列包括Seq_1、Seq_2、Seq_3和Seq_4中的一种;所述下游引物的序列包括Seq_5、Seq_6、Seq_7和Seq_8中的一种。
3.根据权利要求2所述的引物组合,其特征在于,所述上游引物的序列包括Seq_1;所述下游引物的序列包括Seq_6。
4.根据权利要求1所述的引物组合,其特征在于,所述crRNA包括框架核酸片段序列和向导序列;所述向导序列包括Seq_14、Seq_15和Seq_16中的一种。
5.根据权利要求4所述的引物组合,其特征在于,所述框架核酸片段序列包括Seq_13;所述向导序列包括Seq_15。
6.根据权利要求1-5任意一项所述的引物组合,其特征在于,所述RPA引物对包括Seq_1和Seq_6;所述crRNA包括框架核酸片段序列Seq_13和向导序列Seq_15。
7.用于检测大丽轮枝菌的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-6任意一项所述引物组合,还包括DEPC水、LwaCas13a缓冲液、LwaCas13a蛋白、NTP buffer mix、T7 RNApolymerase mix、RNase inhibitor、RNA Reporter和大丽轮枝菌质粒标准品。
8.权利要求1-6任意一项所述引物组合或者权利要求7所述试剂盒在检测大丽轮枝菌中的应用。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,包括如下步骤:
S1、提取待测样本基因组DNA,以所述待测样本基因组DNA为模板,进行RPA扩增,得到RPA产物;
S2、以所述RPA产物为模板,构建大丽轮枝菌CRISPR/Cas13检测体系。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,步骤S2所述CRISPR/Cas13检测体系为:DEPC水8.4μl、LwaCas13a缓冲液2μl、LwaCas13a蛋白1μl、crRNA 2μl、NTP buffer mix 1μl、T7 RNA polymerase mix 0.6μl、RNase inhibitor 0.5μl、RNA Reporter 2.5μl和大丽轮枝菌RPA产物2μl。
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