[发明专利]大蒜生物指纹图谱构建和识别方法、终端设备及存储介质在审
申请号: | 202211252879.X | 申请日: | 2022-10-13 |
公开(公告)号: | CN115631796A | 公开(公告)日: | 2023-01-20 |
发明(设计)人: | 刘国伟 | 申请(专利权)人: | 济宁市农业科学研究院 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B30/00;G06F18/24;G06F18/214;G06F16/901 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 甘莹 |
地址: | 250000*** | 国省代码: | 山东;37 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 大蒜 生物 指纹 图谱 构建 识别 方法 终端设备 存储 介质 | ||
1.一种大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,包括:
获取特定大蒜品种的数量性状和质量性状;
获取基于遗传差异性分析方法分析得到的所述特定大蒜品种的遗传差异性;
根据所述遗传差异性,构建所述特定大蒜品种的SSR数字指纹图谱;
汇总所述数量性状、所述质量性状和所述SSR数字指纹图谱,构建特定大蒜品种的生物指纹图谱。
2.如权利要求1所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,所述获取特定大蒜品种的数量性状和质量性状,包括:
所述数量性状包括:形态学性状;
所述质量性状包括:生态学性状、品质性状。
3.如权利要求1所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,所述获取特定大蒜品种的数量性状和质量性状,包括:
根据大蒜品种来源地信息,确定所述特定大蒜的品种来源地;
对所述品种来源地的生态条件、品种类型、形态学性状和品质性状进行鉴定,得到包含所述特定大蒜品种的数量性状和质量性状的鉴定结果。
4.如权利要求1所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,基于遗传差异性分析方法分析得到所述特定大蒜品种的遗传差异性,包括:
提取所述特定大蒜品种的成熟新生叶片的DNA;
依次对所述DNA进行引物的合成及筛选,PCR扩增及荧光标记,电泳检测,获得电泳检测结果;
对所述电泳检测结果进行分析,获得第一分析结果;
根据所述第一分析结果,确定具有片段多样性的多对引物,得到所述特定大蒜品种的遗传差异性。
5.如权利要求4所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,对所述DNA进行引物的合成及筛选,包括:
根据转录组测序的生物信息学对所述DNA进行分析得到的SSR位点引物信息,筛选出位点不重复的第一预设数量对第一引物;
在所述第一预设数量对第一引物的所有正向引物F的5’端加上通用Tag的16个碱基的引物序列,合成第一预设数量对第二引物;
利用Tag修饰引物和各自对应的反向R引物,对所述第一预设数量对第二引物进行扩增,合成第二预设数量对第三引物;
对所述第二预设数量对第三引物进行检测,得到第二分析结果;
根据第二分析结果,筛选出第三预设数量对片段多态性好、特异性高的第四引物。
6.如权利要求5任一项所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,根据所述遗传差异性,构建所述特定大蒜品种的SSR数字指纹图谱,包括:
根据所述遗传差异性,统计SSR检测结果的带型,将每对引物在样品上扩增出的每一种带型,有条带的用“1”表示,无条带的用“0”表示;
根据所述第三预设数量对引物的扩增顺序,串联每个样品的全部引物上的扩增带型数据,得到用“0”和“1”表示的每个样品的指纹图谱代码;
将所述指纹图谱代码整理为带型矩阵数据,得到所述特定大蒜品种的SSR数字指纹图谱。
7.如权利要求1至5任一项所述的大蒜生物指纹图谱构建方法,其特征在于,所述汇总所述数量性状、所述质量性状和所述SSR数字指纹图谱,构建特定大蒜品种的生物指纹图谱,包括:
汇总所述数量性状、所述质量性状和所述SSR数字指纹图谱,形成生物指纹图谱数据条;
利用信息编码技术,将所述生物指纹图谱数据条构建为生物指纹图谱。
8.一种基于权利要求1至7任一项所述的大蒜生物指纹图谱构建方法实现的大蒜生物指纹图谱识别方法,其特征在于,包括:
扫描所述特定大蒜品种的生物指纹图谱,获得所述特定大蒜品种的特征信息和SSR数字指纹图谱;
根据所述特定大蒜品种的特征信息和SSR数字指纹图谱,对所述特定大蒜品种进行鉴定和分类。
9.一种终端设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至7任一项或8所述的方法。
10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时,实现如权利要求1至7任一项或8所述的方法。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于济宁市农业科学研究院,未经济宁市农业科学研究院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202211252879.X/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。