[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及应用

说明书

本发明属于包含核酸的检测方法领域，涉及一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及应用。所述鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法，包括：检测待测猪基因组中SNP标记的基因型，根据基因型鉴定猪眼肌面积；所述SNP标记为位于10.2版猪参考基因组的猪17号染色体第47,077,245位核苷酸，其为T或C；TC基因型猪的眼肌面积高于TT基因型和CC基因型，TT基因型猪的眼肌面积高于CC基因型。本发明提供了与猪眼肌面积相关的SNP位点，并发现该SNP位于猪17号染色体第47,077,245核苷酸位点处，与猪的眼肌面积极显著相关，通过检测该SNP标记的不同基因型，可以用于猪眼肌面积的遗传改良并改善猪肉品质。

技术领域

本发明属于包含核酸的检测方法领域，涉及一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及应用。

背景技术

猪肉是人类饮食中动物蛋白的主要来源，其消费量占肉类消费的一半以上。对猪肉产量和品质的研究一直是畜牧学者关注的重点。眼肌面积是衡量猪肉用性能的重要指标，科学地开展猪眼肌面积的研究，对于改善猪肉品质具有重要意义。

猪生长发育主要由个体遗传因素所决定，其中猪眼肌面积是遗传力较高的性状，与猪瘦肉率直接相关，同时也是猪遗传育种工作中最主要的选择指标之一。随着一些直接活体扫描测量眼肌面积先进仪器设备的问世，为眼肌面积表型的测定提供了更为准确的方法，也为该性状的选择工作提供了关键的前期保障。

SNP(single nucleotide polymorphism)是由单碱基引起的突变，在基因组中广泛分布，因此对SNP位点进行筛选和发掘具有非常重要的意义。近年来，越来越多的SNP位点被用于基因功能发掘、疾病控制和生长性能等关联分析的相关研究中，相关SNP检测技术也在不断完善和发展。

发明内容

本发明的目的是提供与猪眼肌面积相关SNP标记的开发和利用方法，进而提供一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及应用。

本发明提供一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法，所述方法包括：检测待测猪基因组中SNP标记(命名为WU_10.2_17_47077245)的基因型；所述SNP标记为位于10.2版猪参考基因组的猪17号染色体第47,077,245位核苷酸(如序列1所示序列的第101位核苷酸，序列表中用y表示)，其为T或C；TC基因型猪的眼肌面积高于TT基因型和CC基因型，TT基因型猪的眼肌面积高于CC基因型；所述CC基因型为所述SNP为C的纯合型；所述TC基因型为所述SNP为C和T的杂合型；所述TT基因型为所述SNP为T的纯合型。

所述SNP标记WU_10.2_17_47077245为位于10.2版猪参考基因组的猪17号染色体上如序列1所示序列的第101位核苷酸，其为T或C(序列表中用Y表示)。

检测所述的SNP标记的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积中的应用也应在本发明的保护范围之内。

其中，所述物质为SNP芯片。

检测所述的SNP标记的多态性或基因型的物质在猪育种中的应用也应在本发明的保护范围之内。

其中，所述物质为SNP芯片。

上述SNP芯片为Neogen公司的Neogen_POR80K芯片

其中，所述猪育种为培育猪眼肌面积大的猪品种。

本发明提供一种猪的育种方法，所述方法包括：检测待测猪基因组中所述的SNP标记的基因型，选择纯合CC基因型与TT基因型的猪进行交配育种。

其中所述猪的育种为培育猪眼肌面积大的猪品种。

上述猪(待测猪)为长白猪、大白猪和杜洛克猪。