[发明专利]控制方法及解析系统在审
申请号: | 202211323280.0 | 申请日: | 2022-10-27 |
公开(公告)号: | CN116072221A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 脇元立;田中克则;鹫尾尊规 | 申请(专利权)人: | 希森美康株式会社;株式会社理真思 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B20/20 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 郑天松 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 控制 方法 解析 系统 | ||
本发明提供进行基于第1设施取得的核酸序列数据,在第2设施中使用同一受试者的多个核酸序列数据的解析的计算机的控制方法等。控制在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪2得到解析委托方设施10的核酸序列数据由第2设施解析的计算机。从解析委托方设施10经网络11接收与含从同一受试者的受试体调制的第1及第2库的多个库试样的各自相对应的含使用测序仪2得到的多个核酸序列数据的序列数据集和表示第1及第2库试样从同一受试者的受试体调制的关联信息。对与第1及第2库试样的各自相对应的第1及第2核酸序列数据进行解析,输出基于第1及第2序列数据的解析结果的解析信息。
【技术领域】
本发明涉及控制用于在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的计算机的控制方法。另外,本发明涉及在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的解析系统。
【背景技术】
伴随癌基因组医疗的进展,在医疗设施中,推进实施基因组合检查的体制的整备。在其中,为了活用于新的研究,积累了向检查室导入第二代测序仪(NGS),通过基因组合检查而得到的见解的医疗设施也增加。
一方面,在基因组合检查中,必须由生物信息学家的数据解析。但是,生物信息学家的数少,有难确保人材的情况。因此,在基因组合检查之中,有想要向外部的专门机关委托用医疗设施取得的核酸序列数据的解析的需求。
在专利文献1中记载了,测序仪取得核酸序列数据,向云环境发送取得的核酸序列数据,由云环境解析核酸序列数据的系统。能根据上述专利文献1中记载的系统,将用测序仪取得的核酸序列数据由云环境解析。
【现有技术文献】
【专利文献】
【专利文献1】美国专利9,444,880号公报
【发明的概要】
【发明要解决的课题】
由于NGS通常同时综合测定多数(例如,16)的测定试样(库),以1次的测定得到与从多个受试者采集的多个库的各自相对应的多个核酸序列数据。再者,有因基因组合检查的种类而需要组合解析与从同一受试者的受试体调制的多个库各自相对应的核酸序列数据的情况。
例如,在匹配的对检查中,对从同一受试者采集的肿瘤受试体的核酸序列数据和非肿瘤受试体的核酸序列数据进行组合解析。在这样的情况中,在向外部委托基因组合检查中的核酸序列数据的解析时,在外部的解析设施中,从用NGS取得的多个核酸序列数据之中提取与同一受试者的多个受试体相对应的各自的核酸序列数据的正确的组合,必需对其正确的组合的多个核酸序列数据进行解析。
但是,在上述专利文献1中未考虑,从作为解析委托方设施的医疗设施取得的多个核酸序列数据之中,在外部的解析设施中提取同一受试者的多个核酸序列数据,为了所述受试者执行使用多个核酸序列数据的解析。
从而,本发明的目的在于,提供基于第1设施取得的核酸序列数据,能正确并且迅速地在第2设施中进行使用同一受试者的多个核酸序列数据的解析的控制方法、及解析系统。
【用于解决课题的手段】
本发明的控制方法是控制用于在基因组合检查中将使用读取核酸序列的测序仪由第1设施得到的核酸序列数据由第2设施解析的计算机的控制方法,从上述第1设施经网络接收与含从同一受试者的受试体调制的第1库试样及第2库试样的多个库试样的各自相对应的含使用上述测序仪得到的多个核酸序列数据的序列数据集和表示上述第1库试样及上述第2库试样从上述同一受试者的受试体调制的关联信息,对与由上述关联信息关联的上述第1库试样及上述第2库试样的各自相对应的第1序列数据及第2序列数据进行解析,输出基于上述第1序列数据的解析结果和上述第2序列数据的解析结果的解析信息。
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