[发明专利]辣椒中与控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP及其CAPS特异性引物、鉴定方法在审
| 申请号： | 202211340960.3 | 申请日： | 2022-10-30 |
| 公开（公告）号： | CN116042890A | 公开（公告）日： | 2023-05-02 |
| 发明（设计）人： | 王立浩;曹亚从;程锋;张亢;张令奎;张宏霞;张正海;于海龙;陈姝敏;冯锡刚;吴华茂 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京法信智言知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11737 | 代理人： | 尹超群 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 辣椒 控制 果实 维生素 含量 紧密 连锁 snp 及其 caps 特异性 引物 鉴定 方法 | ||
1.辣椒中与控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP，其特征在于，所述SNP位于辣椒的1号染色体的第32482037bp处，此处基因组碱基为A，变异碱基为G。
2.权利要求1所述的辣椒中与控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP的CAPS特异性引物对，其特征在于，所述引物对包括以下引物：
前引物：F:5’AGGCCCTACAATGTTGAGGT3’，
后引物：R:5’GCAAAGCATGTACCCTAAACTAG3’。
3.一种鉴定高果实维生素C含量的辣椒品种的方法，其特征在于，所述方法包括使用控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP的CAPS特异性引物扩增待测样品的步骤，其中，所述引物对包括以下引物：
前引物：F:5’AGGCCCTACAATGTTGAGGT3’，
后引物：R:5’GCAAAGCATGTACCCTAAACTAG3’。
4.根据权利要求3所述的鉴定高果实维生素C含量的辣椒品种的方法，其特征在于，对PCR扩增引物进行VspI酶切，当控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP位点为G时，PCR产物中有1个VspI酶切位点，琼脂糖凝胶电泳有两条亮带，分别为194bp、117bp；当控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP位点为A时，PCR产物中有两个VspI酶切位点，琼脂糖凝胶电泳仅有明显的194bp亮带。
5.根据权利要求3所述的鉴定高果实维生素C含量的辣椒品种的方法，其特征在于，当所述控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP位点的碱基为A时，利用广泛靶向代谢组方法测定的辣椒果实的维生素C含量的离子流强度每秒计数值大于9.0E+6cps；当所述控制果实维生素C含量紧密连锁的SNP位点的碱基为C时，利用广泛靶向代谢组方法测定的辣椒果实的维生素C含量的离子流强度每秒计数值小于9.0E+6cps。
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