[发明专利]一种SNP检测方法及试剂盒在审
申请号: | 202211388142.0 | 申请日: | 2022-11-08 |
公开(公告)号: | CN115521974A | 公开(公告)日: | 2022-12-27 |
发明(设计)人: | 刘小芳;李文书 | 申请(专利权)人: | 南通和福生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 226299 江苏省南通市启*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 snp 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种SNP检测试剂盒,配方包括:Tris、(NH4)2SO4、KCl、MgCl2、dATP、dCTP、dGTP、dTTP、MTHFR 677R1、MTHFR 677T-F1、MTHFR C677-F1、MTHFR 677T-MGB、MTHFR C677-MGB、Taq酶、DNA模板以及水,其特征在于:各组分的用量或终浓度分别是:10~50mM的Tris、125~375mM的(NH4)2SO4、0~50mM的KCl、1.5~5mM的MgCl2、0.05~0.4uM的dATP、0.05~0.4uM的dCTP、0.05~0.4uM的dGTP、0.05 ~0.4uM的dTTP、0.05~1pM的MTHFR 677R1、0.05~0.5pM的MTHFR 677T-F1、0.05~0.5pM的MTHFR C677-F1、0.05~0.5pM的MTHFR 677T-MGB、0.05~0.5pM的MTHFR C677-MGB、0.05~0.2U/μl的Taq酶、1~50ng/反应DNA模板以及适量的水。
2.根据权利要求1所述的一种SNP检测试剂盒,其特征在于:所述Tris、(NH4)2SO4、KCl、MgCl2、dATP、dCTP、dGTP、dTTP、MTHFR 677R1、MTHFR 677T-F1、MTHFR C677-F1、MTHFR 677T-MGB、MTHFR C677-MGB、Taq酶、DNA模板以及水的总体积之和为30μL。
3.根据权利要求1所述的一种SNP检测试剂盒,其特征在于:所述Tris的pH为8.3。
4.根据权利要求1所述的一种SNP检测试剂盒,其特征在于:所述水为经过处理的纯化水。
5.一种SNP检测方法,包括以下步骤:步骤一,设计引物;步骤二,引入突变;步骤三,设计探针;步骤四,提取;步骤五,处理;步骤六,反应;其特征在于:
其中上述步骤一中,在SNP位置设计ARMS-qPCR引物;
其中上述步骤二中,为了减少引物的非特异扩增,两条等位基因引物在SNP位点前后1-2个碱基处,人为各引入一个突变;
其中上述步骤三中,设计等位基因特异性的MGB探针;
其中上述步骤四中,采用外周血DNA提取试剂盒提取EDTA或枸橼酸钠抗凝的基因组DNA;
其中上述步骤五中,采用荧光PCR仪、高速离心机、低速离心机、恒温干浴器、漩涡震荡仪、冰箱以及其他设备对SNP进行处理;
其中上述步骤六中,使用SNP检测试剂盒对步骤五中处理后的SNP进行检测,在检测反应的过程中,第一步为在95℃的环境温度下进行10分钟的一个循环;第二步为在95℃的环境温度下处理10秒,然后在60℃的环境温度下处理35秒,然后进行45个循环,设置在60℃下进行检测FAM、HEX的荧光收集;第三步为在25℃的环境温度下处理10秒;随后即可对反应结果进行分析。
6.根据权利要求5所述的一种SNP检测方法,其特征在于:所述步骤二中,引入的突变所处的位置是不同的。
7.根据权利要求5所述的一种SNP检测方法,其特征在于:所述步骤三中,等位基因存在3个碱基差异,因此MGB探针不容易非特异杂交显色。
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