[发明专利]一种与大豆龙骨瓣开放相关的分子标记及其应用

权利要求书

1.一种与大豆龙骨瓣开放相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为在基因编号为Glyma.03g124400的第33746105处存在A＞C突变。

2.一种与大豆龙骨瓣开放相关的蛋白，其特征在于，所述蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO.1所示。

3.编码权利要求2所述蛋白的基因，其特征在于，所述基因的CDS序列如SEQ ID NO.2所示。

4.一种扩增权利要求1所述分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

5.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述蛋白或权利要求3所述基因或权利要求4所述引物对在以下一种或多种方面中的应用，其特征在于，包括：

1)制备鉴定或筛选龙骨瓣开放大豆的产品；

2)鉴定或筛选龙骨瓣开放的大豆；

3)辅助培育龙骨瓣开放的大豆品种。

6.一种鉴定或筛选龙骨瓣开放的大豆的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求4所述的引物对。

7.一种鉴定或筛选龙骨瓣开放的大豆的方法，其特征在于，包括以下步骤：

以待鉴定大豆的基因组DNA为模板进行PCR扩增，得到扩增产物；所述PCR扩增中所用的引物包括：权利要求4所述的引物对；

根据扩增产物中权利要求1所述分子标记对应位点的基因型判断大豆龙骨瓣的性状，具体如下：

若所述对应位点的基因型为AA或AC，则待鉴定大豆为闭合龙骨瓣；

若所述对应位点的基因型为CC，则待鉴定大豆为开放龙骨瓣。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述基因型的判断方法包括测序或电泳；

当判断方法为电泳时，包括：利用AluⅠ酶对扩增产物进行酶切，对酶切产物进行电泳分析；

若仅有一条282bp的电泳条带，则所述分子标记对应位点的基因型为CC；

若仅有一条257bp的电泳条带，或者仅有两条分别为257bp和25bp的电泳条带，则所述分子标记对应位点的基因型为AA；

若有两条分别为282bp和257bp的电泳条带，或者有三条分别为282bp、257bp和25bp的电泳条带，则所述分子标记对应位点的基因型为AC。

9.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序包括：95℃预变性5min；95℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸5min。

10.大豆龙骨瓣开放的主效QTL，其特征在于，所述主效QTL被定位在大豆第3号染色体上，物理位置为SSR1043与SSR1045之间，区间大小58Kb。