[发明专利]一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记

说明书

本发明提供一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记，涉及家禽基因工程育种技术领域。所述鸡毛孔间距性状的分子遗传标记为鸡I型α1胶原蛋白链(COL1A1)基因42外显子13021位点SNP即COL1A1(10321：TC)。该分子遗传标记基因型通过引物F：5’‑GAAGC TGGACGTGAGGTAGG‑3’；R：5’‑GACATAAGCACGGATCGGCA‑3’进行PCR扩增与测序所得。本发明克服了现有技术的不足，提供一种鸡的毛孔间距的分子遗传标记，用于毛孔间距性状分子标记辅助选择，可实现对毛孔间距性状的早期选择，降低育种成本，并加快毛孔间距性状育种进展。

技术领域

本发明涉及家禽基因工程育种技术领域，具体涉及一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记。

背景技术

随着我国家禽“规模养殖、集中屠宰、冷链运输、冰鲜上市”政策的全面实施。胴体外观在肉鸡销售中越来越重要，胴体外观包括皮肤颜色、毛孔直径和毛孔密度等，其中毛孔间距大小反应鸡毛孔密度。毛孔间距小则毛孔密度大，毛孔间距大则毛孔密度小。在冰鲜销售模式下，毛孔间距过小或过大都会降低鸡胴体美观度进而影响鸡销售。目前，大多数鸡品种内部不同个体之间毛孔间距存在较大的差异。因此，在鸡育种中迫切需要对毛孔间距性状开展选择来对鸡品种进行遗传改良。

目前对鸡毛孔间距选择采用的是传统的选育方法，即在青年期至继代前对毛孔间距多次测定，并根据毛孔间距测定表型值，利用BLUP估计育种值进行选择。然而，活鸡毛孔间距性状测定繁琐并且难以精确度量。因此，采用传统选育方法存在测定成本高、测定时间长、选择效率低、无法实现对毛孔间距性状早期选种以及育种进展缓慢等问题。

发明内容

针对现有技术不足，本发明提供一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记。利用现代生物技术，候选基因分析，发现鸡I型α1胶原蛋白链(COL1A1)基因42外显子13021位点SNP即COL1A1(10321：TC)与鸡的毛孔间距显著相关，不同基因型鸡毛孔间距关系为CC型CT型TT型。该位点可作为鸡毛孔间距性状的分子遗传标记，用于毛孔间距性状分子标记辅助选择，实现对毛孔间距的早期选择，并可加快育种进展。

为实现以上目的，本发明的技术方案通过以下技术方案予以实现：

一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记，所述分子遗传标记为COL1A1基因42外显子13021位点SNP。

本发明还提供了一种鸡毛孔间距性状基因型鉴定的方法，包括以下步骤：

步骤S1：PCR引物合成：

上游引物F：5’-GAAGCTGGACGTGAGGTAGG-3’；

下游引物R：5’-GACATAAGCACGGATCGGCA-3’；

步骤S2：利用鸡DNA模板与引物进行PCR扩增，扩增的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。

步骤S3：PCR产物测序后进行SNP分型。

所述步骤S2具体包括PCR反应体系和PCR反应程序；

所述PCR反应体系包括：添加模板DNA 1μL，添加上游引物1μL，添加下游引物1μL，添加2×HieffTM PCR MasterMix 10μL，添加ddH₂O7μL；

所述PCR反应程序包括：第一步94℃起始变性5min，第二步94℃解链30s，第三步62℃退火30s，第四步72℃延伸1min，其中解链到延伸循环次数为35次，第五步72℃最终延伸10min，第六步4℃保存。

本发明提供一种鸡毛孔间距性状的分子遗传标记，与现有技术相比优点在于：