[发明专利]基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法及系统在审

专利信息
申请号: 202211541515.3 申请日: 2022-12-02
公开(公告)号: CN116110594A 公开(公告)日: 2023-05-12
发明(设计)人: 花睿;周雪忠;舒梓心;杨扩 申请(专利权)人: 北京交通大学
主分类号: G16H50/70 分类号: G16H50/70;G06F40/295
代理公司: 北京市商泰律师事务所 11255 代理人: 邹芳德
地址: 100044 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 基于 关联 文献 医学知识 图谱 知识 评价 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,包括:

基于远程监督,获取医学实体与文献的关联证据信息;

基于显著性检验,构建医学关系与文献的关联证据信息;

融合远程监督和显著性检验,基于医学实体与文献的关联证据信息、医学关系与文献的关联证据信息,构建知识-关联文献知识图谱、文献-文献关联图谱;

基于构建的知识-关联文献知识图谱、文献-文献关联图谱,对获取的医学知识可靠性进行评价。

2.根据权利要求1所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,基于远程监督,获取医学实体与文献的关联证据信息,包括:通过集成医学知识库,搜集药物、成分、基因、疾病、症状共5种实体;通过远程标注将实体映射到文献上下文句子中;对于疾病和基因实体,结合预训练模型进行微调测试,对于药物、成分以及症状实体,使用远程监督命名实体方法进行训练,形成医学实体与文献的关联证据信息。

3.根据权利要求1所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,基于显著性检验,构建医学关系与文献的关联证据信息,包括:基于命名实体识别模型获取所有包含相关医学实体的句子;通过判断句子中实体是否存在于知识图谱的三元组中,区分为正负样本;通过T检验对比正负样本之间的差异,筛选数据集,形成医学关系与文献的关联数据;建立针对特定知识图谱关系的远程监督算法,训练远程监督关系抽取模型,利用训练好的远程监督关系抽取模型抽取医学关系-文献关联证据信息。

4.根据权利要求3所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,对于正样本,计算每条正样本和其余正样本的相似性的均值,并且排序,取前K个样本作为真正例;对于每条负样本,判断其是否是真假例,首先计算K个真正例的内部相似性,得到真正例的分布P;其次计算该条负样本s和和K个真正例的相似度,得到负样本的分布N;对两个分布进行T检验,计算得到P值;如果p小于设定的阈值,则认为该条负样本为真假例,否则继续判断两个分布的均值,如果N的均值小于P的均值,则认为该条负样本为真假例。

5.根据权利要求4所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,对获取的医学知识可靠性进行评价,包括:利用远程监督方法,得到所有包含特定医学知识关系的句子,通过每条样本关联的PubMed IDs,获得文献的相关信息,从而形成知识-文献关联网络,包含三元组知识和文献两类节点、知识-文献和文献引用两类边关系,利用节点特征和边关系特征,同时结合文献的多维度特征进行知识的可靠性评价。

6.根据权利要求4所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法,其特征在于,针对一条特定的知识,从远程监督模型、知识-文献关联网络、相关文献特征多个角度进行评价。

7.一种基于关联文献的医学知识图谱的知识评价系统,其特征在于,包括:

获取模块,用于基于远程监督,获取医学实体与文献的关联证据信息;基于显著性检验,构建医学关系与文献的关联证据信息;

构建模块,用于融合远程监督和显著性检验,基于医学实体与文献的关联证据信息、医学关系与文献的关联证据信息,构建知识-关联文献知识图谱、文献-文献关联图谱;

评价模块,用于基于构建的知识-关联文献知识图谱、文献-文献关联图谱,对获取的医学知识可靠性进行评价。

8.一种非暂态计算机可读存储介质,其特征在于,所述非暂态计算机可读存储介质用于存储计算机指令,所述计算机指令被处理器执行时,实现如权利要求1-6任一项所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法。

9.一种计算机程序产品,其特征在于,包括计算机程序,所述计算机程序当在一个或多个处理器上运行时,用于实现如权利要求1-6任一项所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法。

10.一种电子设备,其特征在于,包括:处理器、存储器以及计算机程序;其中,处理器与存储器连接,计算机程序被存储在存储器中,当电子设备运行时,所述处理器执行所述存储器存储的计算机程序,以使电子设备执行实现如权利要求1-6任一项所述的基于关联文献的医学知识图谱的知识评价方法的指令。

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