[发明专利]一种与乌苏里貉体重相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明属于分子遗传学技术领域，具体涉及与乌苏里貉体重大小相关的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记位于貉参考基因组NYPRO_anot_genome的Nypro681序列上第128151处的C/T碱基突变，不同基因型的乌苏里貉个体体重表现出显著差异，为乌苏里貉体重性状的标记辅助选择育种提供新的标记资源。本发明利用PCR技术和Sanger测序法检测上述SNP分子标记，并将其应用于乌苏里貉体重性状早期选择上，建立一种乌苏里貉体重性状分子标记辅助选择技术，以指导其选种选配，从而缩短育种周期，加快育种进程，降低育种成本。

技术领域

本发明涉及SNP分子标记技术领域，尤其涉及一种与乌苏里貉体重相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

貉是人工饲养的重要经济动物之一，其经济价值主要来源于毛皮。貉皮属大毛细皮，有轻便、保暖、美观等优点，多数被用来加工成服装的帽条、袖口等，在国际裘皮市场占据重要地位。因此，皮张质量的优劣直接影响养殖者的经济效益。在貉养殖中，体型性状如体重等是最重要的经济性状之一，直接决定皮张尺码的大小和毛皮等级的划分。在貉育种工作中，将体重等作为主要指标选育出大体型的貉，是当前貉育种的主要目标。

随着分子生物学技术在畜禽育种工作中的广泛应用，在许多畜禽上都发现了与其经济性状紧密连锁的SNP分子标记，并使用这些分子标记进行辅助选择育种，极大地加快了育种进程。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)主要是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上DNA序列多态性，形式包括单个碱基的缺失、插入、转换及颠换。SNP作为第三代遗传标记，广泛应用于动植物育种中。因此，在貉育种中，开发和运用遗传标记是当前育种工作的主要研究方向，同时采用分子标记指导育种，对貉经济性状的遗传改良具有重要意义。

发明内容

本发明的目的是为了解决现有技术中存在的缺点，而提出的一种与乌苏里貉体重相关的SNP分子标记及其应用。

本发明的目的之一在于：提供一种与乌苏里貉体重相关的SNP分子标记，位于貉参考基因组的Nypro681序列上第128151处点的碱基处，该SNP分子标记位点具有C/T多态性。

Nypro681的GenBank登录号：CAJHUB010000647.1；貉参考基因组的信息版本号为NYPRO_anot_genome，2021年2月。

优选地，所述含有SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述的SNP分子标记位于第171位。

优选地，所述SNP分子标记多态性位点的CC基因型的体重显著高于CT基因型和TT基因型，而CT基因型的体重又显著高于TT基因型。

本发明的目的之二在于：提供上述SNP分子标记在乌苏里貉体重性状检测或乌苏里貉育种中的应用。

本发明的目的之三在于：提供上述SNP标记的引物对，上游引物如SEQ ID NO.2所示，下游引物如SEQ ID NO.3所示。

本发明的目的之四在于：提供上述引物对在乌苏里貉体重性状检测或乌苏里貉育种中的应用。

本发明的目的之五在于：提供一种试剂盒，含有上述引物对。

本发明的目的之六在于：提供一种预测乌苏里貉体重性状的方法，检测如上述SNP分子标记的多态性位点基因型。

优选地，采用上述引物对或上述试剂盒进行检测。

具体包括以下步骤：

(1)提取乌苏里貉血液基因组DNA，作为模板DNA；

(2)利用上述引物对，将步骤(1)获得的基因组DNA进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；

(3)对步骤(2)获得的PCR扩增产物纯化、测序，并获得测序结果；