[发明专利]一种妊娠期并发症风险预测模型及其应用

权利要求书

1.一种妊娠期并发症风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

(1)获取基因表达的biomaker；

(2)获取临床指征信息；

(3)将差异基因TSS信息与获取的临床指征信息联合构建预测模型；

优选的，步骤(1)包括筛选差异基因TSS；

优选的，利用获取的TSS的区域深度信息筛选差异基因TSS；

优选的，通过将获取的TSS的区域深度信息转换为rpkm来筛选差异基因TSS；

优选的，将TSS的区域深度信息转换为rpkm的公式为rpkm＝read counts/(mappedreads(Millions)*TSS length(KB)；

优选的，TSS的区域深度信息指的是转录组起始位点上下游1000bp区域内的深度信息；

优选的，差异基因筛选标准为|log₂FC|＝1且FDR0.1；

优选的，步骤(1)还包括对筛选的差异基因TSS进一步通过特征选择法筛选；

优选的，所述特征选择法为递归特征消除法；

优选的，步骤(1)进一步包括计算通过递归特征消除法筛选的差异基因TSS的阈值；

优选的，所述阈值为约登指数；

优选的，依据得到的阈值对差异基因TSS进行二值化处理；

优选的，步骤(3)中通过逻辑回归方法构建预测模型；

优选的，所述妊娠期并发症为子痫前期。

2.一种妊娠期并发症风险预测模型，其特征在于，所述风险预测模型根据权利要求1所述的方法构建而成；

优选的，所述差异基因包括ABHD17A、CFAP157、CTNNBIP1、CTR9、FAM227A、LILRA5、NPTN、NSD1、OBP2B、OR10H4、PAQR9、PLK3、PRSS58、SLC45A1、SP140L、SSR3、STAT1、STK31、TLE1、TMEM238；

优选的，所述临床指征包括孕妇年龄、孕妇孕周、ffDNA、T21、T18、T13、BMI、受孕方式、无创指征、不良孕产史、是否多产、既往剖宫产数量；

优选的，所述妊娠期并发症为子痫前期。

3.根据权利要求2所述的风险预测模型，其特征在于，所述风险预测模型表示为：

logit(P)＝0.046×ABHD17A-0.037×CFAP157+0.051×CTNNBIP1+0.061×CTR9+0.061×FAM227A-0.049×LILRA5+0.051×NPTN+0.033×NSD1-0.045×OBP2B+0.047×OR10H4-0.048×PAQR9+0.042×PLK3-0.041×PRSS58-0.047×SLC45A1+0.047×SP140L+0.049×SSR3+0.064×STAT1+0.051×STK31-0.030×TLE1+0.056×TMEM238+0.023×年龄-0.074×孕周+0.142×ffDNA-0.003×T21-0.037×T18+0.006×T13+0.121×BMI+0.030×受孕方式+0.032×无创指征+0.030×不良孕产史-0.063×是否多产-0.012×既往剖宫产数量-6.006；

优选的，当logit(P)0.2时，认为具有妊娠期并发症风险；

优选的，所述妊娠期并发症为子痫前期。

4.如下任一种计算机可读存储介质：

1)其存储有程序，该程序用于执行权利要求1所述的方法；

2)其存储有程序，该程序用于执行权利要求2或3所述的风险预测模型；

优选的，所述妊娠期并发症为子痫前期。