[发明专利]一种ABO基因767位碱基替换诱导的剪接变体及应用在审
申请号: | 202211708993.9 | 申请日: | 2022-12-29 |
公开(公告)号: | CN116334110A | 公开(公告)日: | 2023-06-27 |
发明(设计)人: | 金银戈;韩东旭;周小青;郑伟;席嘉慧;宁丽;鹿璇;高月;李双鹏;吴曼虹;唐成程;邹庆剑;陈敏;江晓汕;赖良学 | 申请(专利权)人: | 五邑大学 |
主分类号: | C12N15/54 | 分类号: | C12N15/54;C12N15/113;C12N9/22;C12N15/11;C12Q1/6876 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 周全英 |
地址: | 529000*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 abo 基因 767 碱基 替换 诱导 剪接 变体 应用 | ||
1.一种ABO基因767位碱基替换诱导的剪接变体,所述767位碱基替换为ABO基因第7外显子的C.767tC取代,其特征在于,所述剪接变体的第4外显子有29bp插入或第6外显子有3bp缺失。
2.根据权利要求1所述的剪接变体,其特征在于,所述插入为:由CATGGCTGTTAGGGAACCTGACCATCTGCAGCGCGTCTCGTTGCCAAG突变为CAGCTGGAGTGATCTTTCCAGAACATAAGCATGGCTGTTAGGGAACCTGACC ATCTGCAGCGCGTCTCGTTGCCAAG。
3.根据权利要求1所述的剪接变体,其特征在于,所述缺失为:第6外显子起始位置的TAG碱基缺失。
4.权利要求1所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)采用ABE编辑系统和sgRNA对ABO基因767位碱基进行T突变C,筛选克隆得到ABO基因c.767TC的突变细胞;
(2)分析所述突变细胞全基因组测序数据中indel和SNP的数量和/或频率;分析所述突变细胞转录组测序数据中的差异表达基因;
(3)提取所述突变细胞的RNA,反转录得cDNA;
(4)分析cDNA的ABO基因的剪接位点,即得剪接变体。
5.根据权利要求4所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,所述sgRNA的核苷酸序列为gtcccaggcctacatcccca。
6.根据权利要求4所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,在步骤(4)中,对所述cDNA进行PCR扩增和TA克隆连接。
7.根据权利要求6所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,所述PCR的引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
8.一种血型鉴定的试剂盒,其特征在于,包括检测引物对,所述检测引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
9.权利要求1~3任一项权利要求所述的剪接变体、权利要求4~8任一项所述的诱导方法在血型鉴定中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述血型鉴定为ABO*Ael05/B101亚型表型鉴定。
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