[发明专利]一种ABO基因767位碱基替换诱导的剪接变体及应用在审

专利信息
申请号: 202211708993.9 申请日: 2022-12-29
公开(公告)号: CN116334110A 公开(公告)日: 2023-06-27
发明(设计)人: 金银戈;韩东旭;周小青;郑伟;席嘉慧;宁丽;鹿璇;高月;李双鹏;吴曼虹;唐成程;邹庆剑;陈敏;江晓汕;赖良学 申请(专利权)人: 五邑大学
主分类号: C12N15/54 分类号: C12N15/54;C12N15/113;C12N9/22;C12N15/11;C12Q1/6876
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 周全英
地址: 529000*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 abo 基因 767 碱基 替换 诱导 剪接 变体 应用
【权利要求书】:

1.一种ABO基因767位碱基替换诱导的剪接变体,所述767位碱基替换为ABO基因第7外显子的C.767tC取代,其特征在于,所述剪接变体的第4外显子有29bp插入或第6外显子有3bp缺失。

2.根据权利要求1所述的剪接变体,其特征在于,所述插入为:由CATGGCTGTTAGGGAACCTGACCATCTGCAGCGCGTCTCGTTGCCAAG突变为CAGCTGGAGTGATCTTTCCAGAACATAAGCATGGCTGTTAGGGAACCTGACC ATCTGCAGCGCGTCTCGTTGCCAAG。

3.根据权利要求1所述的剪接变体,其特征在于,所述缺失为:第6外显子起始位置的TAG碱基缺失。

4.权利要求1所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)采用ABE编辑系统和sgRNA对ABO基因767位碱基进行T突变C,筛选克隆得到ABO基因c.767TC的突变细胞;

(2)分析所述突变细胞全基因组测序数据中indel和SNP的数量和/或频率;分析所述突变细胞转录组测序数据中的差异表达基因;

(3)提取所述突变细胞的RNA,反转录得cDNA;

(4)分析cDNA的ABO基因的剪接位点,即得剪接变体。

5.根据权利要求4所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,所述sgRNA的核苷酸序列为gtcccaggcctacatcccca。

6.根据权利要求4所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,在步骤(4)中,对所述cDNA进行PCR扩增和TA克隆连接。

7.根据权利要求6所述的剪接变体的诱导方法,其特征在于,所述PCR的引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。

8.一种血型鉴定的试剂盒,其特征在于,包括检测引物对,所述检测引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。

9.权利要求1~3任一项权利要求所述的剪接变体、权利要求4~8任一项所述的诱导方法在血型鉴定中的应用。

10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述血型鉴定为ABO*Ael05/B101亚型表型鉴定。

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