[发明专利]一种基于多亲本的遗传图谱标记开发方法与装置及计算机可读存储介质

权利要求书

1.开发遗传图谱标记的方法，其特征在于：所述方法用于对具有未知亲本的遗传群体进行遗传群体作图，所述方法包括：从所述遗传群体的包含变异核苷酸位点的基因型文件中，获取所述遗传群体的推测母本样本与推测父本样本的基因型集合；统计所述基因型集合的基因型信息，得到所述遗传群体的亲本基因型统计文件；根据所述亲本基因型统计文件，结合所述遗传群体的类型，确定所述遗传群体的亲本的基因型组合类型，得到所述遗传群体的父本和母本的基因型；整合所述基因型文件中的所述遗传群体的变异核苷酸位点、所述遗传群体的父本和母本基因型以及所述遗传群体的基因型信息得到所述遗传群体的遗传图谱作图标记文件；对所述遗传图谱作图标记文件中的遗传图谱作图标记进行连锁分析，得到所述遗传群体的遗传图谱标记。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述统计基因型集合的基因型信息，具体包括统计所述遗传群体的推测母本样本的基因型类别和属于所述基因型类别的所述推测母本样本的数量，以及统计所述遗传群体的推测父本样本的基因型类别和属于所述基因型类别的所述推测父本样本的数量的过程。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：所述遗传群体的亲本的基因型组合类型包括：nnxnp，abxcc，hkxhk，abxcd，lmxll，efxeg，aaxbb和/或ccxab；

所述aaxbb代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的父本和母本的基因型均为纯合且有差异；

nnxnp代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为纯合，所述遗传群体的父本的基因型为杂合且与所述母本的基因型有一个核苷酸相同；

abxcc代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为杂合，所述遗传群体的父本的基因型为纯合且与所述母本的基因型无相同的核苷酸；

hkxhk代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为杂合，所述遗传群体的父本的基因型为杂合且与所述母本的核苷酸相同；

abxcd代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为杂合，所述遗传群体的父本的基因型为杂合且与所述母本无相同的核苷酸；

lmxll代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为杂合，所述遗传群体的父本的基因型为纯合且与所述母本有一个相同的核苷酸；

efxeg代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为杂合，所述遗传群体的父本的基因型为杂合且与所述母本有一个相同的核苷酸；

ccxab代表所述亲本的基因型组合为：所述遗传群体的母本的基因型为纯合，所述遗传群体的父本的基因型为杂合且与母本无相同的核苷酸。

4.根据权利要求1-3中任一权利要求所述的方法，其特征在于：所述遗传群体为F₂群体、DH群体、RIL重组自交系群体、BC回交群体或F₁拟测交群体。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于：所述F₂群体、DH群体、RIL重组自交系群体或BC回交群体对应的所述亲本的基因型组合类型为aaxbb；所述F₁拟测交群体对应的所述亲本的基因型组合类型为nnxnp，abxcc，hkxhk，abxcd，lmxll，efxeg，和/或ccxab。

6.根据权利要求1-5中任一权利要求所述的方法，其特征在于：对所述遗传图谱作图标记文件中的遗传图谱作图标记进行连锁分析包括使用joinmap软件对所述遗传图谱作图标记文件进行连锁分析去除所述遗传图谱作图标记的重复连锁位点的步骤。

7.一种存储有计算机程序的计算机可读存储介质，所述计算机程序使计算机执行如权利要求1-6中任一权利要求方法的步骤。