[发明专利]基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法

权利要求书

1.基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，包括如下步骤：

(1)编号DNA序列

从任意一端开始对给定DNA片段的碱基B进行依次编号：B₁、B₂、B₃、B₄…；

(2)筛选特征性片段

取所述给定DNA片段中的富G碱基片段，标定其中第一个碱基G为有效碱基G_x，x为所述第一个碱基G在所述给定DNA片段中的编号；从G_x碱基开始计数，至G_x+n碱基位数截止，选B_x-y至B_x+n+z为G-DNA有效特征性片段；35≥n≥9，10≥y≥0，10≥z≥0；

(3)分析G碱基特征

分析有效特征性片段中由连续几个G碱基构成的G结构单元，其中不同碱基数量的G结构单元分别标记为GM，M为G结构单元中G碱基数量；

(4)计数GM结构单元

分别计算每种GM结构单元的数量N；

(5)G-DNA结构判别

标记并分别计算相邻G结构单元之间碱基数量S；

M≥2，N≥1，8≥S≥1，且有效特征性片段中存在结构重复单元则判别为G-DNA结构；

所述有效特征性片段中存在结构重复单元，指有效特征性片段中：

对于一种G结构单元，非连续重复至少4个；

或对于至少两种G结构单元形成的组合结构，非连续重复至少2个。

2.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，所述有效特征性片段碱基数不超过36个。

3.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，所述任意一端为3’端和/或5’端。

4.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，所述有效特征性片段中G碱基占比为10％～80％。

5.根据权利要求4所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，所述有效特征性片段中G碱基占比为35～80％。

6.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，35≥n≥16，4≥y≥0，4≥z≥0。

7.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，5≥M≥2。

8.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，12≥N≥3。

9.根据权利要求1所述的基于GMNS法则的G-DNA结构判别方法，其特征在于，4≥S≥1。