[发明专利]基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用

说明书

本发明属于癌症检测制剂技术领域，具体涉及一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用。该乳腺癌标志物包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CAsupgt;H1047R/supgt;、PIK3CAsupgt;E542K/supgt;、PIK3CAsupgt;E545K/supgt;、TP53supgt;R175C/supgt;、TP53supgt;R248W/supgt;、TTNsupgt;R6745C/supgt;、GATA3supgt;M294K/supgt;、GATA3supgt;S238R/supgt;、CDH1supgt;L630V/supgt;、KMT2Csupgt;K339N/supgt;或KMT2Csupgt;G315S/supgt;。该乳腺癌标志物在TCGA中进行筛查发现其对乳腺癌的诊断敏感性可高达79.39％，可以准确定位乳腺癌；相对于CancerSEEK，用更少的检测靶点(11vs69)，得到了乳腺癌检测更高的敏感性(79.39％vs33％)。

技术领域

本发明属于癌症检测制剂技术领域，具体涉及一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物及其应用。

背景技术

目前社会上基于循环肿瘤DNA的乳腺癌筛查技术主要为CancerSEEK，CancerSEEK是一种依赖ctDNA检测的非侵入性多基因检测，用于早期筛查包括乳腺癌在内的八种癌症。

Nickolas等首先从网上公布的数据中，从16个癌症相关基因中筛选出61个扩增子和41个癌症相关蛋白，然后通过进一步验证，筛选出41个癌症相关蛋白中的8个。之后，他们对1005名确诊的癌症患者和812名健康人进行了CancerSEEK测试。结果发现卵巢癌敏感性最高为98％，乳腺癌敏感性最低为33％，中位敏感性为70％，特异性为＞99％。但本研究纳入的肿瘤患者多为有临床表现的肿瘤患者，无症状患者CancerSEEK检出率可能较低。此外，他们的对照组都是健康的人，但在实践中，慢性疾病和炎症可能导致较高的假阳性。而且，CancerSEEK由于其检测癌种的多样性，其检测靶点较多有61个基因靶点以及8个癌种相关蛋白，且在检测后的癌种定位中会存在一定的误差。单纯针对某一种癌种来说，病人所承担的经济负担较重，诊断的准确性也会随之降低。

因此，亟需一种检测靶点少，且检测准确的乳腺癌检测制剂。

发明内容

针对以上问题，本发明目的之一在于提供一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，该乳腺癌标志物在TCGA中进行筛查发现其对乳腺癌的诊断敏感性可高达79.39％，可以准确定位乳腺癌。

为达到上述目的，可以采用以下技术方案：

本发明一方面提供了一种基于循环肿瘤DNA的乳腺癌标志物，包括以下突变位点基因中一种或多种：PIK3CA^H1047R、PIK3CA^E542K、PIK3CA^E545K、TP53^R175C、TP53^R248W、TTN^R6745C、GATA3^M294K、GATA3^S238R、CDH1^L630V、KMT2C^K339N或KMT2C^G315S。

本发明另一方面提供了一种检测制剂，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂。

本发明再一方面提供了一种检测试剂盒，其包括用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂或上述的检测试剂。

本发明再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备乳腺癌检测制剂中的应用。

本发明再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备乳腺癌检测试剂盒中的应用。

本发明再一方面提供了一种用于检测上述的乳腺癌标志物的试剂在制备用于检测乳腺癌的微流控芯片中的应用。