[发明专利]一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法及应用

权利要求书

1.一种评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1、测量参考群体的生长性状和抗性性状；

S2、对参考群体进行全基因组重测序及SNP分型；

S3、针对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状和抗性性状相关的SNP位点；

S4、基于不同的SNP标记数量建立全基因组选择模型；

S5、基于最佳全基因组选择模型计算参考群体和验证群体的基因组育种值；

S6、根据参考群体和验证群体的基因组育种值计算综合育种值。

2.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，所述方法还包括：

根据基因组育种值与实际表型的相关性评估全基因组选择模型的预测准确性，选取最佳全基因组选择模型。

3.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S1步骤中，所述测量参考群体的生长性状和抗性性状的具体步骤包括：先对参考群体进行暂养驯化，暂养期间正常投喂；而后选取体质健壮、摄食状况良好的个体，给予胁迫因子处理，经环境胁迫死亡后记录其生长指标和死亡时间，分别作为生长和抗性性状的表型。

4.根据权利要求2所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S5步骤中，计算参考群体和验证群体的基因组育种值时基于所述选取最佳全基因组选择模型。

5.根据权利要求2所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S4、S5步骤中，采用五折交叉验证评估全基因组选择模型的预测准确性。

6.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S2步骤中，所述对参考群体进行全基因组重测序的具体步骤包括：

提取参考群体中每个个体的总基因组DNA；

对所述总基因组DNA进行检测；

对检测合格的总基因组DNA进行随机打断，纯化筛选符合要求的DNA片段，并将DNA片段连接测序接头，再通过滚环扩增制备DNA纳米球，对制备的DNA纳米球进行测序。

7.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S2步骤中，所述SNP分型的具体步骤包括：

对全基因组重测序数据进行质控和过滤；

将质控和过滤后的全基因组重测序数据比对至参考基因组数据，并消除全基因组重测序数据中PCR偏好性的影响；

对消除PCR偏好性后的全基因组重测序数据进行单核苷酸多态性检测，实现基因分型。

8.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S3步骤中，所述针对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析的具体步骤包括：

对全基因组重测序数据进行过滤；

填充测序缺失的SNP；

分别对生长性状和抗性性状进行全基因组关联分析。

9.根据权利要求1所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法，其特征在于，S6步骤中，所述根据参考群体和验证群体的基因组育种值计算综合育种值的具体步骤包括：

对参考群体和验证群体的基因组育种值进行归一化处理；

在归一化处理结果中分别赋予生长性状和抗性性状相应的权重，计算综合育种值。

10.权利要求1～9中任意一项所述的评估花鲈生长和抗性性状综合育种值的方法应用于花鲈育种。