[发明专利]SNPs分子标记g.43236T>C和g.43289C>G在湖羊分子标记辅助育种中的应用在审
申请号: | 202310088814.4 | 申请日: | 2023-01-16 |
公开(公告)号: | CN116121403A | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
发明(设计)人: | 高慧;李奎;姜俊芳 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州恒翌专利代理事务所(特殊普通合伙) 33298 | 代理人: | 王从友 |
地址: | 310022 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | snps 分子 标记 43236 43289 湖羊 辅助 育种 中的 应用 | ||
1.一种与湖羊体高、断奶到六月龄日增重和六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关的SNPs分子标记,其特征在于,该分子标记定位为g.43236T>C和/或g.43289C>G;其中:
g.43236T>C与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,TT基因型的体高显著高于TC,CC个体,TC显著高于CC,TT与TC的断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于CC个体,CC基因型的周岁重显著高于TC,TT;
g.43289C>G与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,CC,CG的体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于GG基因型个体,GG型个体的周岁重显著高于CC与CG。
2.一种用于检测权利要求1中所述SNPs分子标记的引物对。
3.权利要求2所述的引物对扩增获得的扩增产物,该扩增产物的序列如SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示。
4.一种用于扩增权利要求3所述的扩增产物的引物对。
5.根据权利要求4所述的引物对,其特征在于,
扩增如SEQ ID NO:1序列的产物,引物对的序列如SEQ ID NO:3 和SEQ ID NO:4所示;
扩增如SEQ ID NO:2序列的产物,引物对的序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
6.一种包含权利要求2或4或5所述引物对的试剂盒。
7.权利要求1所述的SNPs分子标记、权利要求2或4或5所述的引物对和权利要求6所述的试剂盒在筛选体高、断奶到六月龄日增重和六月龄到周岁日增重以及周岁重性状和湖羊分子标记育种中的应用;其中:
g.43236T>C与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,TT基因型的体高显著高于TC,CC个体,TC显著高于CC,TT与TC的断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于CC个体,CC基因型的周岁重显著高于TC,TT;
g.43289C>G与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,CC,CG的体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于GG基因型个体,GG型个体的周岁重显著高于CC与CG。
8.一种筛选湖羊体高、断奶到六月龄日增重和六月龄到周岁日增重以及周岁重性状的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:提取湖羊外周血基因组DNA,采用权利要求2或4或5所述的引物对进行PCR扩增,对扩增产物中权利要求1所述的SNPs分子标记进行检测,从而筛选出湖羊的体高、断奶到六月龄日增重和六月龄到周岁日增重以及周岁重性状;其中:
g.43236T>C与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,TT基因型的体高显著高于TC,CC个体,TC显著高于CC,TT与TC的断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于CC个体,CC基因型的周岁重显著高于TC,TT;
g.43289C>G与体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重以及周岁重显著相关,CC,CG的体高,断奶到六月龄日增重,六月龄到周岁日增重显著高于GG基因型个体,GG型个体的周岁重显著高于CC与CG。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,PCR 反应体系为25 μL,KOD OneTM PCRMaster Mix12.5 μL,全血模板1μL,上下游引物各0.2 μL,ddH2O 11.1 μL;反应程序为:98℃变性10 s, 退火30 s,68 ℃延伸30 s,扩增 34 个循环,PCR 结束后4 ℃保存。
10.权利要求8过9所述的方法在湖羊分子标记育种中的应用。
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