[发明专利]用于编辑植物中的组蛋白H3K27me3的SunTag系统、载体及编辑方法在审

专利信息
申请号: 202310105502.X 申请日: 2023-02-13
公开(公告)号: CN115894721A 公开(公告)日: 2023-04-04
发明(设计)人: 姜丹华;鲁井云;宋瑞甜;张怀仁 申请(专利权)人: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
主分类号: C07K19/00 分类号: C07K19/00;C12N15/113;C12N15/82;C07K14/415
代理公司: 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 代理人: 厉洋洋
地址: 100101 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 用于 编辑 植物 中的 组蛋白 h3k27me3 suntag 系统 载体 方法
【权利要求书】:

1.一种用于编辑植物中组蛋白H3K27me3的SunTag系统,其特征在于,所述SunTag系统包括连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶、连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白以及引导RNA;所述引导RNA可将所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶、所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白定位在待编辑的目标基因上;

其中,所述核酸内切酶为失活的Cas9、失活的Cas12、失活的Cas13、失活的Cas14中的一种,所述效应蛋白为REF6蛋白的无锌指结构域的部分、拟南芥的JMJ13蛋白或拟南芥的JMJ11蛋白。

2.根据权利要求1所述一种用于编辑植物中组蛋白H3K27me3的SunTag系统,其特征在于,所述引导RNA包括七个RNA片段,分别为:如SEQ ID NO:11所示的guide RNA1、如SEQ IDNO:12所示的guide RNA2、如SEQ ID NO:13所示的guide RNA3、如SEQ ID NO:14所示的guide RNA4、如SEQ ID NO:15所示的guide RNA5、如SEQ ID NO:16所示的guide RNA6以及如SEQ ID NO:17所示的guide RNA7。

3.根据权利要求2所述一种用于编辑植物中组蛋白H3K27me3的SunTag系统,其特征在于,所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶为dCas9-10×GCN4,所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白为scFv-sfGFP-REF6△ZnF。

4.一种用于编辑植物中组蛋白H3K27me3的载体,其特征在于,所述载体采用权利要求1~3任意一项所述的用于编辑组蛋白H3K27me3的SunTag系统构建而成。

5.一种如权利要求4所述的载体的构建方法,其特征在于,采用第一启动子、第二启动子、所述SunTag系统、筛选标记基因、入门载体以及终载体构建所述用于编辑组蛋白H3K27me3的载体;其中,所述第一启动子为两个,分别用于驱动所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶和所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白;所述第二启动子为用于驱动所述引导RNA的启动子。

6.根据权利要求5所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述第一启动子为如SEQ IDNO:1所示的pUBQ10;所述第二启动子包括如SEQ ID NO:7所示的AtU6-1、如SEQ ID NO:8所示的AtU6-29、如SEQ ID NO:9所示的AtU3b以及如SEQ ID NO:10所示的AtU3d。

7.根据权利要求6所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述筛选标记基因为潮霉素抗性基因HygR。

8.根据权利要求7所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述构建的方法为GreenGate,所述入门载体为pGGA、pGGB、pGGC、pGGD、pGGE和pGGF,所述终载体为pZ304;

构建步骤为:分别构建pGGA-AtU6-1:guide RNA1-AtU6-1:guide RNA2-AtU6-29:guideRNA3-AtU6-29:guide RNA4-AtU3b:guide RNA5-AtU3b:guide RNA6-AtU3d:guide RNA7、pGGB-dCas9-10×GCN4、pGGC-pUBQ10、pGGD-pUBQ10:scFv-sfGFP、pGGE-REF6 △ZnF、pGGF-HygR的载体片段;

再将所述终载体与上述各载体片段依次连接,连接过程中,pGGA、pGGB、pGGC、pGGD、pGGE、pGGF被去除,得到所述用于编辑组蛋白H3K27me3的载体:pZ304-AtU6-1:guide RNA1-AtU6-1:guide RNA2-AtU6-29:guide RNA3-AtU6-29:guide RNA4-AtU3b:guide RNA5-AtU3b:guide RNA6-AtU3d:guide RNA7-pUBQ10:dCas9-10×GCN4-pUBQ10:scFv-sfGFP-REF6 △ZnF-HygR。

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