[发明专利]拉氏鱥微卫星标记组合及引物对组合物及应用在审
申请号: | 202310196300.0 | 申请日: | 2023-03-03 |
公开(公告)号: | CN116287304A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 白晓慧;张韦;杨华;薄其康;刘克明;汪笑宇;李春燕;何晓旭;李晶晶 | 申请(专利权)人: | 天津市水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 陆艺 |
地址: | 300221 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 拉氏鱥微 卫星 标记 组合 引物 应用 | ||
1.拉氏鱥微卫星标记组合,其特征在于该组合包括微卫星标记:PL02、PL08、PL09、PL12、PL17、PL19、PL25、PL27、PL36、PL42、PL44、PL60、PL62、PL63、PL65和PL68,所述微卫星标记的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.16所示。
2.检测权利要求1所述拉氏鱥微卫星标记组合的引物对组合物,其特征是所述引物对组合物包括如下引物对:
检测第1微卫星标记PL02的引物对:正向引物为SEQ ID NO.17,反向引物为SEQIDNO.18;
检测第2微卫星标记PL08的引物对:正向引物为SEQ ID NO.19,反向引物为SEQIDNO.20;
检测第3微卫星标记PL09的引物对:正向引物为SEQ ID NO.21,反向引物为SEQIDNO.22;
检测第4微卫星标记PL12的引物对:正向引物为SEQ ID NO.23,反向引物为SEQIDNO.24;
检测第5微卫星标记PL17的引物对:正向引物为SEQ ID NO.25,反向引物为SEQIDNO.26;
检测第6微卫星标记PL19的引物对:正向引物为SEQ ID NO.27,反向引物为SEQIDNO.28;
检测第7微卫星标记PL25的引物对:正向引物为SEQ ID NO.29,反向引物为SEQIDNO.30;
检测第8微卫星标记PL27的引物对:正向引物为SEQ ID NO.31,反向引物为SEQIDNO.32;
检测第9微卫星标记PL36的引物对:正向引物为SEQ ID NO.33,反向引物为SEQIDNO.34;
检测第10微卫星标记PL42的引物对:正向引物为SEQ ID NO.35,反向引物为SEQIDNO.36;
检测第11微卫星标记PL44的引物对:正向引物为SEQ ID NO.37,反向引物为SEQIDNO.38;
检测第12微卫星标记PL60的引物对:正向引物为SEQ ID NO.39,反向引物为SEQIDNO.40;
检测第13微卫星标记PL62的引物对:正向引物为SEQ ID NO.41,反向引物为SEQIDNO.42;
检测第14微卫星标记PL63的引物对:正向引物为SEQ ID NO.43,反向引物为SEQIDNO.44;
检测第15微卫星标记PL65的引物对:正向引物为SEQ ID NO.45,反向引物为SEQIDNO.46;
检测第16微卫星标记PL68的引物对:正向引物为SEQ ID NO.47,反向引物为SEQIDNO.48。
3.权利要求2的引物对组合物在拉氏鱥遗传多样性检测中的应用。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征是包括如下步骤:
(1)拉氏鱥基因组DNA的提取;
(2)微卫星标记的PCR扩增:在权利要求2所述的引物对组合物中的正向引物5’端连接荧光基团进行修饰,以拉氏鱥基因组DNA为模板,用对应的修饰的正向引物,和反向引物进行PCR扩增,获得扩增产物;
(3)扩增产物在ABI 3730XL基因分析仪上进行分型,用GS-500LIZ作为内参,用peakScanner Software v1.0软件读取个体的基因型;
(4)遗传多样性分析:根据每个个体微卫星标记的基因型,利用PopGene 32计算遗传多样性参数。
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