[发明专利]一种与阿司匹林抵抗辅助诊断相关的SNP标志物组合、引物合集及其应用有效

专利信息
申请号: 202310243490.7 申请日: 2023-03-14
公开(公告)号: CN116083562B 公开(公告)日: 2023-08-25
发明(设计)人: 刘清源;郭帅炜;王凯文;张亚南;吴俊;莫少华 申请(专利权)人: 北京寻医问译科技发展有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 代理人: 荣红颖;刘春成
地址: 101115 北京市通州区恒*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 阿司匹林 抵抗 辅助 诊断 相关 snp 标志 组合 引物 及其 应用
【说明书】:

发明涉及体外诊断技术领域,具体涉及一种与阿司匹林抵抗辅助诊断相关的SNP标志物组合、引物合集及其应用。所述标志物为rs6065、rs1131882、rs4523、rs12042763、rs20417和rs1799983的组合,本发明提供的标志物组合与引物合集可应用于识别阿司匹林抵抗高危人群,应用方法简单而且准确性高。

技术领域

本发明涉及体外诊断技术领域,具体涉及一种与阿司匹林抵抗辅助诊断相关的SNP标志物组合、引物合集及其应用。

背景技术

遗传的基本物质是DNA,基因则是位于染色体上有遗传效应的DNA片段,对于储存在生物全套染色体中的全部遗传信息,可称其为基因组。单核苷酸多态性(SingleNucleotide Polymorphisms,SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,包括碱基的颠换、转换、插入和缺失。它是人类可遗传变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。

目前用于检测SNP的基因技术相当多样且成熟。(1)Sanger测序是DNA序列分析的经典方法,可直接获取核酸序列信息,是SNP检测的“金标准”。(2)TaqMan探针是一种双标记、自淬灭的水解探针,其5’和3’末端分别标记荧光基团和淬灭基团,在探针结构完整时两者距离较近,荧光基团的信号可被淬灭,释放荧光基团,使得荧光信号增强。(3)扩增阻滞突变系统PCR(Amplification Refractory Mutation System PCR,ARMS-PCR),又称为等位基因特异性PCR(Allele-Specific PCR,AS-PCR),是基于Taq DNA聚合酶无法修复引物3’末端的单个碱基错配,从而使得扩增受阻的检测方法。(4)分子信标法通过一段双标记的寡核苷酸探针,其5’末端和3’末端分别标记荧光基团和淬灭基团,且探针5’端和3’端的部分碱基可互补配对,从而形成茎环结构,使得荧光基团和淬灭基团相互靠近而荧光信号较低。(5)基因芯片(gene chip)是指将大量针对SNP的寡核苷酸探针高密度地固定在一固相支持物表面,从而形成多重寡核苷酸微阵列,而经荧光染料标记后的待测DNA片段,与芯片上固定好的探针阵列进行杂交反应,核酸片段只与其序列完全互补配对的探针杂交,不与含有单个错配碱基的序列杂交,从而将目标序列固定下来,再通过清洗去除非目标片段,最后通过扫描检测芯片上的荧光信号,由此确定SNP位点。

目前临床判断患者是否对阿司匹林存在抵抗是困难的,通常采用测定血小板功能的方法间接判断患者是否存在阿司匹林抵抗,但这些方法大都缺乏特异性,而且不同测定方法之间的一致性很差。在阿司匹林抵抗众多的影响因素中,遗传因素不仅有着显著影响,而且具有稳定性。因此通过SNP引物组合来识别阿司匹林抵抗的高风险人群,以此来判断患者的临床预后并调整药物治疗方案,具有巨大的发展潜力。目前已有的用于辅助诊断阿司匹林抵抗的SNP组合存在预测结果准确性差的问题,依靠该预测结果给患者使用阿司匹林或不使用阿司匹林存在不可靠性,因此,开发一种预测结果更精准的SNP组合和方法是非常必要的。

发明内容

针对现有技术存在的不足,本发明提供一种阿司匹林抵抗辅助诊断相关的SNP标志物组合、引物合集及其应用。

为实现上述目的,本发明采取的技术方案为:

第一方面,本发明提供一种与阿司匹林抵抗辅助诊断相关的SNP标志物组合,所述标志物组合为rs6065(人17号染色体第34933086位)、rs1131882(人19号染色体第3595925位)、rs4523(人19号染色体第3595796位)、rs12042763(人1号染色体第186682744位)、rs20417(人1号染色体第186681189位)和rs1799983(人7号染色体第150999023位)。

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