[发明专利]用于选择性扩增MYD88基因L265P突变型的组合物、试剂和应用在审
申请号: | 202310361942.1 | 申请日: | 2023-04-06 |
公开(公告)号: | CN116411082A | 公开(公告)日: | 2023-07-11 |
发明(设计)人: | 陶勇;陆成慧;盛怡 | 申请(专利权)人: | 智德明创生物科技(无锡)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 刘桐亚 |
地址: | 214028 江苏省无锡市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 选择性 扩增 myd88 基因 l265p 突变型 组合 试剂 应用 | ||
1.用于选择性扩增MYD88基因L265P突变型的组合物,其特征在于,所述组合物包括引物对1和阻断探针,所述阻断探针靶向MYD88基因的核酸片段覆盖编码第265位氨基酸的CDS片段,所述引物对1包括靶向阻断探针上游的正向引物和靶向阻断探针下游的反向引物;
所述阻断探针为肽核酸修饰探针。
2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,所述阻断探针靶向MYD88基因的片段范围包括编码第265位氨基酸的密码子的上游至少3个核苷酸和/或下游至少3个核苷酸,所述阻断探针的核苷酸长度为13~20bps;
优选地,所述阻断探针靶向MYD88基因的片段范围包括编码第265位氨基酸的密码子的上游至少7个核苷酸和/或下游至少6个核苷酸,所述阻断探针的核苷酸长度为14bps;
优选地,所述阻断探针的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示。
3.根据权利要求2所述的组合物,其特征在于,所述引物对1的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No:2所示,所述引物对1的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No:3所示。
4.根据权利要求3所述的组合物,其特征在于,所述组合物还包括用于定性或定量检出MYD88基因L265P突变型扩增结果的检测探针1;
优选地,所述检测探针1连有荧光基团,或者,所述检测探针1连有荧光基团和淬灭基团;
优选地,所述荧光基团选自FAM、VIC、ROX或CY5;
优选地,所述淬灭基团选自MGB、BHQ1、BHQ2或BHQ3;
优选地,所述检测探针1的核苷酸序列如SEQ ID No:4所示。
5.权利要求1~4任一项所述的组合物在MYD88基因L265P突变型选择性扩增或在MYD88基因L265P突变型检测中的应用。
6.用于选择性扩增MYD88基因L265P突变型的试剂或试剂盒,其特征在于,所述试剂或试剂盒包括权利要求1~4任一项所述的组合物,和用于检测内参基因的引物对2和检测探针2;
所述内参基因包括RNase P基因。
7.根据权利要求6所述的试剂或试剂盒,其特征在于,所述引物对2的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID No:5所示,所述引物对2的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No:6所示,所述检测探针2的核苷酸序列如SEQ IDNo:7所示;
优选地,所述检测探针2连有荧光基团,或者,所述检测探针2连有荧光基团和淬灭基团,且所述检测探针2的荧光基团和检测探针1的荧光基团不同;
优选地,所述荧光基团选自VIC、FAM、ROX或CY5;
优选地,所述淬灭基团选自MGB、BHQ1、BHQ2或BHQ3。
8.选择性扩增MYD88基因L265P突变型的方法,其特征在于,将待测样本和权利要求6或7所述的试剂加入PCR扩增体系中,经扩增得到富含MYD88基因L265P突变型的扩增产物。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR包括数字PCR或荧光定量PCR。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增程序为:95℃下预变性10min,循环1次;95℃下变性30s,72℃下PNA结合30s,58℃下退火延伸1min,循环45次。
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