[发明专利]一种与奶牛乳成分性状相关基因KLF6的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与奶牛乳成分性状相关基因KLF6的SNP分子标记的应用。本发明所要保护的一个技术方案是检测SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状中的应用。实验证明SNP1和/或SNP2的相关分子标记，及相应单倍型和基因型可用于奶牛乳成分性状的早期预测和筛选，有助于进行高乳成分性状奶牛品种的选育。

技术领域

本发明涉及分子生物技术领域中一种与奶牛乳成分性状相关基因KLF6的SNP分子标记及其应用。

背景技术

KLF6基因位于牛13号染色体上，有2个外显子，基因全长8460bp，是一种广泛表达的锌指转录因子，在细胞分化、增殖和肌肉发育等多个生命进程调控中起着重要作用。该基因有三个转录本，mRNA长度分别为5639bp、4310bp和3842bp，分别编码309、280和267个氨基酸(ARS-UCD1.2)，参与了脂肪生成、芳基碳氢化合物受体和转化生长因子-β(transforminggrowth factor-β,TGF-β)信号通路。有研究表明，KLF6基因可促进脂肪细胞分化；在肝脏上，有研究表明其可通过活化PPARα信号通路而引起肝脏非酒精性脂肪肝生成。KLF6属于特异性蛋白/Krüppel样因子(SP/KLF)转录因子家族，可激活或抑制与调控不同细胞和生物过程有关的各种基因，如血管重塑、细胞分化、增殖和凋亡、组织发育和生长。KLF6全敲除或肝细胞特异性缺失的小鼠体内脂肪含量降低，糖耐量和胰岛素耐受性增强，并可免受高脂饮食所导致的脂肪变性的影响。在肝细胞中，KLF6的缺失使PPARα的调控基因(TRB3，PEPCK)减少，PPARα的蛋白表达减少，而PPARα的m RNA无变化，这是因为KLF6抑制miRNA-10b的表达水平，进一步调控PPARα表达水平。

研究表明，KLF6蛋白的生长抑制功能通过转录激活细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂与细胞周期控制有关。KLF6通过编码一种跨膜蛋白来抑制脂肪的形成，同时也扮演着Delta-like 1(DLK1)的转录抑制剂的角色，DLK1是脂肪生成的关键调节因子，编码一种跨膜蛋白，抑制脂肪细胞的分化，它在脂肪细胞发育的分化阶段发挥作用，直接刺激肝脏葡萄糖激酶，调节肝脏胰岛素敏感性。KLF6在多种组织中高度表达，它通过招募到PPARγ启动子区域进行干扰，在前脂肪细胞向脂肪细胞的分化中发挥关键作用，它通过PPARα激活调节基因，PPARα是一种异生物和脂质传感器，调节肝脏脂肪变性、脂蛋白合成、肝脏糖元生成和脂肪酸转运蛋白。

DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链，在DNA聚合酶的参与下，根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现，DNA在高温时也可以发生变性解链，当温度降低后又可以复性成为双链。因此，通过温度变化控制DNA的变性和复性，加入设计引物，DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。聚合酶链式反应(PCR)技术是一种特异性DNA体外扩增技术。目前，该技术已经成为最常用、也最重要的分子生物学技术之一。PCR产物经过琼脂糖凝胶电泳后测序即可进行基因多态的鉴定工作，检测方法简单易行。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定奶牛的乳成分性状或如何进行奶牛育种。

为了解决上述技术问题，本发明首先提供了一种应用，所述应用为下述P1或P2：

所述P1为检测所述SNP1的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状中的应用；

所述P2为检测所述SNP2的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛乳成分性状中的应用；

所述SNP1是奶牛基因组的一个SNP，为序列表中SEQ ID No.1的第88位核苷酸，其为G或A；所述SNP2是奶牛基因组的一个SNP，为序列表中SEQ ID No.1的第341位核苷酸，其为G或A。