[发明专利]一种检测癌症中微卫星不稳定性的生物标志物组及其检测试剂盒和应用在审
申请号: | 202310376568.2 | 申请日: | 2023-04-04 |
公开(公告)号: | CN116479128A | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 陆群;韩晓杰;焦海涛;孙震宏;沈伟强 | 申请(专利权)人: | 浙江绍兴鼎晶生物医药科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 吴波 |
地址: | 312081 浙江省绍兴市柯桥区齐贤街道*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 癌症 卫星 不稳定性 生物 标志 及其 试剂盒 应用 | ||
1.一种检测癌症中微卫星不稳定性的生物标志物组,其特征在于,包括映射至GRCh37/hg19人参考基因组的以下至少4种生物标志物:
第一生物标志物包含9个连续A的同聚物重复,定位在人HDAC4基因中,起始位置为chr2:239,974,110;
第二生物标志物为包含10个连续A的同聚物重复,定位在人RYR3基因中,起始位置为chr15:34,157,542;
第三生物标志物为包含10个连续A的同聚物重复,定位在人BTBD7基因中,起始位置为chr14:93,708,031;
第四生物标志物为包含8个连续A的同聚物重复,定位在人ACVR2A基因中,起始位置为chr2:148,683,686;
第五生物标志物为包含11个连续A的同聚物重复,定位在人MRE11基因中,起始位置为chr11:94,212,931;
第六生物标志物为包含11个连续A的同聚物重复,定位在人DIDO1基因中,起始位置为chr20:61,536,692;
第七生物标志物为包含11个连续A的同聚物重复,定位在人ZNF169基因中,起始位置为chr9:97,063,726;
第八生物标志物为包含11个连续A的同聚物重复,定位在人NDUFS1基因中,起始位置chr2:207,013,835。
2.根据权利要求1所述检测癌症中微卫星不稳定性的生物标志物组,其特征在于,所述第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物、第六生物标志物、第七生物标志物、第八生物标志物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO:1~SEQID NO:8所示。
3.根据权利要求1或2所述检测癌症中微卫星不稳定性的生物标志物组,其特征在于,包括5、6、7或8种所述生物标志物。
4.根据权利要求1或2所述检测癌症中微卫星不稳定性的生物标志物组,其特征在于,所述生物标志物组包括第一生物标志物、第五生物标志物、第七生物标志物和第八生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物和第七生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第五生物标志物和第七生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第三生物标志物、第五生物标志物、第七生物标志物和第八生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物和第七生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物、第七生物标志物和第八生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物、第二生物标志物、第三生物标志物、第四生物标志物、第五生物标志物、第六生物标志物和第七生物标志物;
所述生物标志物组包括第一生物标志物~第八生物标志物。
5.一种检测癌症中微卫星不稳定性的试剂盒,其特征在于,包括不对称扩增权利要求1~4中任意一项所述生物标志物组的引物对和分子信标;
所述不对称扩增所述生物标志物组的引物对的扩增片段长度为60~150bp,包括限制性引物和过量引物;所述限制性引物和过量引物的长度独立为15~27bp,Tm值为55~60℃;
所述分子信标结合在过量引物的延伸链上。
6.根据权利要求5所述检测癌症中微卫星不稳定性的试剂盒,其特征在于,所述分子信标的长度为13~20个碱基,所述分子信标包括锁核酸和/或肽核酸修饰。
7.根据权利要求5所述检测癌症中微卫星不稳定性的试剂盒,其特征在于,所述分子信标包括茎区和环区;所述茎区的长度包括4~7bp;
所述茎区的Tm比环区的Tm高5~10℃。
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