[发明专利]一种基于时序变化关系的病毒癌症风险预测方法和系统

说明书

本发明请求保护一种基于时序变化关系的病毒癌症风险预测方法和系统，通过感知到差异查询请求并响应，在风险预测系统的查询表单的第一输入框内查询第一预测条件的第一字段，感知到在第一字段上的第二查询请求并响应，在第二输入框内查询第二字段，感知到触发第一基因序列的索引的查询请求并响应于触发第一基因序列的索引的查询请求，在第二输入框内查询第一基因序列的基因信号通路，且完成字段更新。用户可以通过简单的点击来对癌症患者中病毒阳性组和病毒阴性组进行最新和最全面的肿瘤免疫浸润的分析和多种免疫浸润算法和可视化呈现，极大地促进了肿瘤病毒学方向免疫治疗领域的进一步发展，从而有助于释放当前数据资源的价值。

技术领域

本发明属于生物基因与数据可视化领域结合，具体的，涉及一种基于时序变化关系的病毒癌症风险预测方法和系统。

背景技术

慢性HBV感染是全球原发性肝细胞癌的主要危险因素之一。高危型HPV感染是导致宫颈病变和宫颈癌的首要因素，此外，HPV感染也逐渐成为头颈部肿瘤及其他肿瘤的主要致病原因。EBV感染与鼻咽癌、淋巴瘤和胃癌的发生发展有关。MCPyV感染主要与一种罕见的致命性MCC的发生密切相关。随着肿瘤免疫治疗，如:程序性死亡蛋白-1(programmed deathprotein-1，PD-1)及其配体(programmed death protein-li-gand1，PD-L1)抑制剂的逐渐成熟与应用，肿瘤与免疫治疗疗效和预后的密切联系越来越受到重视。

研究表明特定病毒感染与肿瘤发生发展密切相关。高通量测序和微阵列技术使得科研人员获得了大量关于病毒感染相关肿瘤患者的表达数据。因此，这些表达数据对于探索病毒的致癌机制对肿瘤治疗提供了理论研究基础。近年来，研究发现病毒感染可能与肿瘤免疫微环境的肿瘤细胞和肿瘤细胞相互关联。然而，目前关于病毒感染相关肿瘤方向的肿瘤免疫微环境分析并未被现有的网页工具所解决。

发明内容

根据本发明第一方面，本发明请求保护一种基于时序变化关系的病毒癌症风险预测方法，所述方法包括：

风险预测系统感知到差异查询请求，所述风险预测系统包括第一预测条件，所述第一预测条件为基因免疫预测条件；

所述风险预测系统响应于所述差异查询请求，在所述风险预测系统的查询表单的第一输入框内查询第一预测条件的第一字段，所述第一字段为所述第一预测条件的病毒阴阳性；

其中，所述查询表单包括至少两个输入框，所述至少两个输入框包括所述第一输入框和第二输入框，不同输入框之间具有索引；

所述风险预测系统感知到在所述第一字段上的第二查询请求，所述第二查询请求用于打开所述第一预测条件的第二字段，所述第二字段与所述第一字段对应不同的数据库GSE样本集，所述第二字段为基因序列列表字段，所述第二字段包括至少一个基因序列的索引；

所述风险预测系统响应于所述第二查询请求，在所述第二输入框内查询所述第二字段；

所述风险预测系统感知到在所述第二字段上的触发第一基因序列的索引的查询请求，所述第一基因序列的索引属于所述至少一个基因序列的索引中的一个；

所述风险预测系统响应于所述触发第一基因序列的索引的查询请求，在所述第二输入框内查询所述第一基因序列的基因信号通路，且将所述第一输入框内查询的所述第一字段更新为所述第二字段，所述第一基因序列的基因信号通路与所述第二字段对应不同的GSE样本集。

进一步地，在所述第二输入框内查询所述第一基因序列的基因信号通路，且将所述第一输入框内查询的所述第一字段更新为所述第二字段之后，所述方法还包括：

所述风险预测系统感知到在所述第二字段上的触发第二基因序列的索引的查询请求，所述第二基因序列的索引属于所述至少一个基因序列的索引中的一个；