[发明专利]一种与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记，所述遗传标记为绵羊FOXN1基因第8外显子上的4个单核苷酸多态性位点之一或任意组合，所述单核苷酸多态性位点分别为绵羊FOXN1基因序列于43371766bp处有G/T突变、43371724bp处有T/C突变、43371682bp处有T/C突变、43371597bp处有C/T突变。由于该4个单核苷酸多态性位点均与绵羊羊毛舒适度性状显著相关，可应用于绵羊羊毛舒适指数和绵羊羊毛纤维直径的分子选育；本发明还提供了可应用于该分子选育的的引物和包含该引物的试剂盒；同时该4个单核苷酸多态性位点的连锁不平衡分析为完全连锁，由其重构形成的单倍型组合也可应用于减小绵羊羊毛纤维直径、提高绵羊羊毛舒适指数选育中。

技术领域

本发明属于绵羊羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的遗传标记育种技术领域，具体涉及一种与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记及其应用。

背景技术

羊毛是纺织业的重要原料，羊毛多产自绵羊，羊毛制品具有柔软、弹性好、吸湿能力强、隔热性能好、穿着舒适、耐磨性好、美观等优点，深受广大消费者的喜爱。随着羊毛市场的开拓激发了人们对羊毛不同性状的需求，羊毛的舒适指数(Comfort Factor，CF)是表征羊毛性状舒适度的性状，是指直径小于30μm的羊毛纤维所占比例，当羊毛织物中有5％或更多的纤维直径超过30μm时，皮肤就会出现刺痛。羊毛纤维直径(Mean Fiber Diameter，MFD)是一般用纤维直径大小或品质支数来表示羊毛的粗细，是确定羊毛品质和使用价值的重要的物理性指标和重要工艺特性。因此较高的羊毛舒适指数、较低的羊毛纤维直径成为质量好或羊毛优质的关键指标。与此同时，随着其他纺织纤维特别是合成纤维的出现，羊毛的市场地位受到了激励的竞争，为了应对这种窘境，羊毛产业亟需提高个体产量和质量，特别是针对羊毛的舒适度的提升，来提高其市场竞争力。

动物分子育种为提高羊毛产量和质量的直接有效措施，动物分子育种方法之一是以分子标记为基础进行标记辅助选择；分子标记辅助选择(Marker assisted selection，MAS)是利用分子标记与目标性状基因紧密连锁的特点，通过分子标记检测即可检测到目的基因的存在，达到选择目标性状的目的。对于羊毛性状分子标记而言，一方面其产量、细度和长度等属于高遗传力性状，是可以进行分子标记辅助选择；另一方面由于羊毛的组成成分复杂，其性状受诸多基因调控，因此难以找到适于进行羊毛分子标记辅助选择来育种所需要的遗传标记。因此，通过羊毛分子标记辅助选择进行育种来提高舒适度指数的前提是找到羊毛舒适度指数和羊毛纤维直径相关的重要经济性状座位或与之连锁的遗传标记。

FOXN1基因(登录号：NC_056064.1和Ensembl:ENSOARG00020023702)为绵羊毛囊发育相关的基因，研究发现FOXN1基因对于羊毛的弯曲具有促进作用，但目前尚未发现FOXN1基因与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记(SingleNucleotide Polymorphism，SNPs)，并针对绵羊进行选育。

发明内容

本发明的第一个目的是针对上述问题，提供一种与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记。

本发明的第二个目的是提供上述单核苷酸多态性遗传标记在减小绵羊羊毛纤维直径和/或提高绵羊羊毛舒适指数选育中的应用。

本发明的第三个目的是提供一种与羊毛舒适指数和羊毛纤维直径相关的单核苷酸多态性遗传标记的单倍型组合序列在提高绵羊羊毛舒适指数选育和/或减小羊毛纤维直径选育中的应用。

本发明的第四个目的是提供一种用于扩增上述单核苷酸多态性遗传标记的引物。

本发明的第五个目的是提供一种用于检测上述单核苷酸多态性遗传标记的试剂盒。

本发明的第六个目的是提供上述引物和试剂盒在减小绵羊羊毛纤维直径和提高绵羊羊毛舒适指数选育中的应用。