[发明专利]丙型肝炎病毒基因型的新顺序及其作为治疗和诊断试剂的用处

权利要求书

1.一种组合物，其特征在于，含有至少一种含8个或更多连续核苷酸的多聚核酸，该连续核苷酸选自至少一种下列HCV顺序：

—  HCV 3型基因组顺序，更具体地为任一下列区域；

—  跨HCV 3a亚型的Core/E1区域的位置417-957的区

    域，

—  跨HCV 3亚型的NS 3区域的位置4664-4730的区域，

—  跨HCV 3亚型的NS 3/4区域的位置4892-5292的区

    域，

—  跨HCV 3a亚型的NS 5区域的位置8023-8235的区

    域，

—  HCV 3c亚型基因组顺序，

—  HCV 2d亚型基因组顺序，    

—  HCV 4型基因组顺序，

—  HCV 5a亚型的编码区域，

其中核苷酸编号对应于表1所示的HCV核酸的编号，而且该核酸在上述区域或其互补区域至少一个与已知的HCV多聚核酸顺序不同的核苷酸。

2.一种如权利要求1所述的组合物，其特征在于，该多聚核酸对应于选自任一列HCV基因组顺序的核苷酸顺序：

—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 13，15，17，19，

    21，23，25或27所示的任一顺序相比，在跨Core/E1区域

    的位置41 7至957的区域中的同源性大于67％，较佳大于

    69％，最佳大于71％或更多；

—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 19，21，23，25

 或27所示的任一顺序相比，在跨E1区域的位置574至

 957的区域中的同源性大于65％，较佳大于67％，最佳大

 于69％或更多；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 147所示的任一

顺序相比，在跨Core区域的位置1至378的区域中的同

源性大于79％，较佳大于81％，最佳大于83％或更多；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 13，15，17，19，

21，23，25或27所示的任一顺序相比，在跨Core/E1区域

的位置417至957的区域中的同源性大于74％，较佳大于

76％，最佳大于78％或更多；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 13，15，17，19，

21，23，25或27所示的任一顺序相比，在跨E1区域的位

置574至957的区域中的同源性大于74％，较佳大于

76％，最佳大于78％或更多；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 29所示的任一

顺序相比，在跨NS 3区域的位置4664至4730的区域中

的同源性大于73.5％，较佳大于74％，最佳大于75％；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 29，31，33，35，

37或39所示的任一顺序相比，在跨NS3/NS4区域的位

置4892至5292的区域中的同源性大于70％，较佳大于

72％，最佳大于74％；—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 5，7，1，3，9或

11所示的任一顺序相比，在跨NS5区域的位置8023至

8235的区域中的同源性大于95％，较佳大于95.5％，最佳

大于96％；—  一个HCV 3a型BR36亚群的HCV基因组顺序，其与

SEQ ID NO 5，7，1，3，9或11所示的任一顺序相比，在跨

    NS5 B区域的位置8023至8192的区域中的同源性大于

    96％，较佳大于96.5％，最佳大于97％；

—  一个HCV基因组顺序，其与SEQ ID NO 149所示的任一

    顺序相比，在跨NS5B区域的位置7932至8271的区域中

    的同源性大于79％，较佳大于81％，最佳大于83％。