[发明专利]鉴别对治疗自身免疫疾病有效的化合物的方法

权利要求书

1.一种测定化合物是否抑制多肽激活转录能力的方法，该多肽其特征在于它包括一个CIITA转录激活结构域而缺失一个有功能的CIITA相互作用结构域，其中转录的抑制表示该化合物是一种潜在的自身免疫疾病治疗药物。

2.权利要求1中的方法，其中转录激活的抑制如下测定：

a)提供一种所述多肽与一种DNA结合蛋白的融合蛋白。

b)提供一种在系统中与报告基因可操作地连接的转录调节DNA序列，该系统在融合蛋白与调节序列连接时适于转录报告基因。

c)在所述系统中提供所述融合蛋白和所述化合物；以及

d)测定所述化合物抑制报告基因转录的能力。

3.权利要求1中的方法，它进一步包括测定化合物抑制第二个多肽激活转录的能力，第二个多肽其特征在于包括一个同型特异CIITA转录激活结构域而缺失一个有功能的CIITA相互作用结构域，其中所述的方法鉴别了同型特异化合物。

4.一种基本纯化的DNA，它编码CIITA转录激活结构域而不编码有功能的CIITA相互作用结构域。

5.权利要求4中的DNA，其中DNA有图1核苷酸192-1142的核苷酸序列，或其简并的变异序列。

6.权利要求4中的DNA，其中DNA80％或更多的序列与图1DNA序列的核苷酸192-1149相同。

7.权利要求4中的DNA，其中CIITA是同型特异的。

8.一种基本纯化的包括一个CIITA转录激活结构域而缺失一个有功能的CIITA相互作用结构域的多肽。

9.权利要求8中的多肽，它包括与图1氨基酸序列氨基酸26-352基本相同的氨基酸序列。

10.权利要求8中的多肽，其中CIITA是同型特异的。

11.一种测定化合物是否抑制多肽与其靶蛋白结合能力的方法，该多肽其特征在于它包括一个CIITA相互作用结构域而缺失一个有功能的CIITA激活结构域，其中结合的抑制表示化合物是潜在的自身免疫疾病治疗药物。

12.权利要求11中的方法，该方法包括测定所述化合物是否抑制上述多肽介导的转录能力，转录的抑制表示化合物为潜在的自身免疫疾病治疗药物。

13.权利要求12的方法，其中所说的抑制如下测定

a)提供第一个包括所述多肽与一种DNA结合蛋白的融合蛋白；

b)为DNA序列提供一种转录调节序列，它在适于转录报告基因的系统中可操作地与报告基因连接；

c)提供第二个融合蛋白，所述第二个融合蛋白其特征在于它包含与CIITA相互作用结构域的靶蛋白融合的转录激活结构域；

d)在系统中提供所述第一个和所述第二个融合蛋白以及所述化合物；以及

e)测定所述化合物抑制报告基因转录的能力。

14.权利要求11中的方法，进一步包括测定所述化合物抑制第二个多肽结合其靶蛋白的能力，上述第二个多肽特征在于它包含一个同型特异CIITA相互作用结构域而缺失一个有功能的CIITA激活结构域，其中所说的方法鉴别同型特异化合物。

15.权利要求14中的方法，其中所述第二多肽包含克隆13 CIITA的相互作用结构域。

16.一种基本纯化的DNA，它编码CIITA相互作用结构域而不编码有功能的CIITA转录激活结构域。

17.权利要求16中的方法，其中所DNA具有图1核苷酸1016-3509的核苷酸序列或其简并的变异序列。

18.权利要求16中的方法，其中所述DNA有80％或更多的序列与图1DNA序列的核苷酸1016-3509的序列相同。

19.权利要求16中的方法，其中CIITA是同型特异的。

20.权利要求19中的方法，其中CIITA为克隆13CIITA。

21.一种基本纯净的多肽，它包括CIITA相互作用结构域而缺失有功能的CIITA转录激活结构域。

22.权利要求21中的多肽，它包含与图1氨基酸序列中氨基酸301-1130基本相同的氨基酸序列。