[发明专利]用新的碱基配对方案减少非特异性杂交无效

专利信息
申请号: 95195880.1 申请日: 1995-08-30
公开(公告)号: CN1164260A 公开(公告)日: 1997-11-05
发明(设计)人: M·L·科林斯;T·霍恩;P·E·希尔顿;B·D·沃纳;M·S·乌达 申请(专利权)人: 奇龙公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C07H19/20
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 代理人: 吴玉和,王景朝
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 碱基配对 方案 减少 非特 异性 杂交
【权利要求书】:

1.一种检测样本中核酸分析物的核酸杂交试验方法,其中用到多种试验组分,每一组分含有至少一段杂交寡聚核苷酸片段,该方法的特征在于:在至少一段杂交寡聚核苷酸片段中引入第一核苷酸单位,该核苷酸单位在形成A-T和G-C碱基对的条件下不能有效地与腺苷(A)、胸苷(T)、胞苷(C)、鸟苷(G)或尿苷(U)形成碱基对。

2.权利要求1的方法,其中第一核苷酸单位能够与互补的第二核苷酸单位形成碱基对。

3.权利要求2的方法,其中第一和第二核苷酸单位可互换地选自以下互补碱基对:和其中R是主链,它允许第一和第二核苷酸单位在被引入多聚核苷酸后与互补的核苷酸单位形成碱基对,R′是氢、甲基、a-或b-丙炔基、溴、氟或碘。

4.一种检测样本中核酸分析物的核酸杂交试验方法,其中用到多种试验组分,每一组分含有至少一段杂交寡聚核苷酸片段,该方法的特征在于:引入Tm1杂交复合物和Tm2杂交复合物,从而控制试验的严谨性,选择性地使Tm1杂交复合物不稳定。

5.一种检测样本中核酸分析物的液相夹心杂交试验方法,其中用到多种试验组分,每一组分含有至少一段杂交寡聚核苷酸片段,该方法包括(a)将分析物直接或间接地结合到固体支持物上,(b)标记分析物,(c)检测与分析物相关的标记是否存在,该方法的特征在于:在至少一段杂交寡聚核苷酸片段中引入第一核苷酸单位,该核苷酸单位在形成A-T和G-C碱基对的条件下不能有效地与腺苷(A)、胸苷(T)、胞苷(C)、鸟苷(G)或尿苷(U)形成碱基对。

6.一种检测样本中核酸分析物的液相夹心杂交试验方法,其中用到多种试验组分,每一组分含有至少一段杂交寡聚核苷酸片段,该方法包括(a)将分析物直接或间接地结合到固体支持物上,(b)标记分析物,(c)检测与分析物相关的标记是否存在,该方法的特征在于:引入Tm1杂交复合物和Tm2杂交复合物,从而控制试验的严谨性,选择性地使Tm1杂交复合物不稳定。

7.一种合成具有如下结构式的化合物的方法,其中R1选自氢、羟基、巯基、卤素、氨基、烷基、烯丙基和-OR2,其中R2是烷基、烯丙基、甲硅烷基或磷酸,该方法包括:

a)用适于保护3′和5′羟基的试剂与具有如下结构式的化合物反应:

b)将步骤(a)的产物与一种适于将O6-氧基元转化成易受亲核置换的官能团的试剂反应,产生官能团化的O6基元;

c)将步骤(b)的产物的2-氨基基团氧化;

d)将步骤(c)的产物与亲核试剂反应,置换功能团化的O6基元;和

e)将步骤(d)的产物与适于将被保护的3′和5′羟基去保护的试剂反应。

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