[发明专利]生理活性化合物的创制方法

权利要求书

1.应用计算机进行生理活性化合物的创制方法，它包含以下工序：

(1)构建收录有网罗了从基本分子骨架上存在的可修饰部位选择的1个或2个以上的取代部位和可以利用的取代基的全部组合的分子结构的化合物数据库；

(2)从该化合物数据库中筛选出满足发挥生理活性所必要条件的分子结构。

2.权利要求1记载的方法，其中作为基本分子骨架，应用了具有所期望生物活性的已知配基的分子骨架或其类似分子骨架。

3.权利要求1记载的方法，其中作为基本分子骨架，应用了以结构自动构建法生成的1个或2个以上的配基候选分子骨架或其类似分子骨架。

4.权利要求1记载的方法，其中作为基本分子骨架，应用了从含具有多种分子骨架的化合物组的化合物数据库中以程序“ADAM&EVE”选择出的1个或2个以上的配基候选分子骨架或其类似分子骨架。

5.权利要求1记载的方法，其中应用了组合构建的2个以上的基本分子骨架。

6.权利要求5记载的方法，其中通过组合的基本分子骨架的构建是通过对具有可修饰部位的1个或2个以上结构单位和1个或2个以上连接部件进行网罗式组合的工序的方法进行。

7.权利要求6记载的方法，其中通过组合进行的基本分子骨架的构建以包含以下工序的方法进行：

(E)从可利用的结构单位中选出1个或2个以上的结构单位；

(F)对于各结构单位根据需要添加使用条件；

(G)从可利用的连接部件中选出1个或2个以上的连接部件；

(H)设定应结合的结构单位数目的上限和下限，对于上述工序(E)和工序(G)所选的全部结构单位和连接部件，在上述工序(F)中付加了使用条件的情况下在其范围内，网罗所有可能的组合，构建出1个或2个以上的基本分子骨架。

8.权利要求1至7中任一项记载的方法，其中上述(2)的筛选工序是通过，包含利用目标生物大分子的配基结合域和分子结构的相互作用而筛选与生物大分子可能结合的分子结构的工序的方法进行。

9.权利要求8记载的方法，其中上述(2)的筛选工序是通过，包含考虑了以生物大分子的结合形式和化合物构象自由度，而对两者最稳定的复合物结构进行检索的工序的方法进行。

10.权利要求1至7中任一项记载的方法，其中上述(2)的筛选工序是通过，包含基于已确定或推测可与生物大分子结合的配基分子的结构和生物大分子的结合形式，筛选可与该生物大分子结合的分子结构的工序的方法进行。

11.权利要求1至7中任一项记载的方法，其中上述(2)的筛选工序是通过，从至少含有化合物原子类型和共有结合形式信息的数据库中用计算机选出可与生物大分子受体结合的候选化合物的方法，即包含根据可与生物大分子结合的1个或2个以上疑问分子的原子类型和共有结合形式的信息进行其与数据库中收录的化物的比较而选择配基候选化合物的工序的方法进行。

12.权利要求1至7中任一项记载的方法，上述(2)的筛选工序是通过根据已确定或推测具有所期望生理活性的化合物的分子结构或该化合物中的官能团的配置，判断与该化合物的类似性的方法进行。

13.应用计算机按数据库检索法进行生理活性化合物创制方法中所用的三维数据库是收入有网罗了从基本分子骨架上存在的可修饰部位中选择的1个或2个以上的取代部位和可利用的取代基之间所有的组合的分子结构的数据库。

14.权利要求13中记载的数据库，其中的基本分子骨架是用具有所期望生理活性的已知配基的分子骨架或其类似分子骨架来构建的。

15.权利要求13中记载的数据库，其中的基本分子骨是用以结构自动构建法构建的配基候选分子骨架或其类似分子骨架来构建的。

16.权利要求13记载的数据库，其中的基本分子骨架是用以程序“ADAM&EVE”从化合物数据库中选出的配基候选分子骨架或其类似分子骨架来构建的。

17.权利要求13记载的数据库，是用组合式构建的2个以上的基本分子骨架构建的。

18.用于存储权利要求13至17中任一项记载的数据库的存储介质。