[发明专利]视黄醇结合蛋白4作为每窝产仔数的基因标记无效
申请号: | 99816168.3 | 申请日: | 1999-01-15 |
公开(公告)号: | CN1334880A | 公开(公告)日: | 2002-02-06 |
发明(设计)人: | M·F·罗特希尔德;C·K·塔格尔;L·A·梅瑟 | 申请(专利权)人: | 衣阿华州立大学研究基金会股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海专利商标事务所 | 代理人: | 徐迅 |
地址: | 美国衣*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 视黄醇 结合 蛋白 作为 产仔 基因 标记 | ||
1.一种筛选动物以确定哪些动物更可能每窝产仔数增加的方法,其特征在于,该方法包括:获得动物的遗传材料的样品;和测定所述样品中视黄醇结合蛋白4基因中多态性的存在,所述多态性与每窝产仔数增加相关联。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述动物是猪。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述测定步骤选自:直接测序分析,限制性片段长度多态性(RFLD)分析,异源双链体分析,单链构象多态性(SSCP)分析,变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,测定所述多态性存在的测定步骤包括:用在至少一处位置切断所述视黄醇结合蛋白4基因的限制性酶消化所述遗传材料;分离消化所产生的片段;测定所述片段产生的限制性模式图;将此模式图与用所述限制性酶得到的生殖基因的另一限制性模式图作比较,其中所述另一模式图与每窝产仔数增加相关联。
5.根据权利要求3所述的方法,其中,所述分离是凝胶电泳。
6.根据权利要求3所述的方法,其中,比较所述限制性模式图的步骤包括鉴定特定大小的片段和比较所述片段的大小。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,测定所述片段不同大小的步骤包括:在存在已知大小的对照DNA片段时,用凝胶电泳按大小分离所述片段;使所述分离的片段与一探针接触,该探针能与所述片段杂交形成探针—片段复合物;通过检测探针—片段复合物的存在与否来确定所分离的片段的大小;确定它们与所述对照DNA片段的相对位置。
8.根据权利要求4所述的方法,其中,该方法还包括在所述消化步骤之前扩增一定量的含所述多态性的生殖基因或其片段。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,用Taq聚合酶进行所述扩增。
10.根据权利要求8所述的方法,其中,所述扩增包括选择正向和反向引物序列的步骤,这些引物能扩增含有多态性位点的所述生殖基因区域。
11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述基因是视黄醇结合蛋白4基因,所述正向和反向引物选自或基于图1所示的序列。
12.根据权利要求11所述的方法,其中,所述引物是TTCCGAGTCAAAGAGAACTTCG和TCATAGTCCGTGTCGATGATCC。
13.根据权利要求11所述的方法,其中,所述引物是GAGCAAGATGGAATGGGTT和CTCGGTGTCTGTAAAGGTG。
14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述限制性酶是MSPI。
15.根据权利要求14所述的方法,其中,所述多态性是190bp限制性长度多态性。
16.根据权利要求14所述的方法,其中,所述多态性是125bp限制性长度多态性。
17.根据权利要求16所述的方法,其中,所述引物是ACTGTGCTCTTTGTGCTG和CTCGGTGTCTGTAAAGGTG。
18.一种测定猪视黄醇结合蛋白4基因中与每窝产仔数增加相关联的多态性位点存在与否的引物,其中,所述引物含有选自或基于图1所示序列的至少4个碱基。
19.根据权利要求18所述的方法,其中,所述引物选自TTCCGAGTCAAAGAGAACTTCG和TCATAGTCCGTGTCGATGATCC,GAGCAAGATGGAATGGGTT,CTCGGTGTCTGTAAAGGTG,ACTGTGCTCTTTGTGCTG和CTCGGTGTCTGTAAAGGTG。
20.一种与每窝产仔数增加相关联的基因标记,其中,所述标记包括视黄醇结合蛋白4基因。
21.根据权利要求20所述的标记,其中,所述标记可通过用引物ACTGTGCTCTTTGTGCTG和CTCGGTGTCTGTAAAGGTG扩增出的所述基因区域中的MSPI多态性来鉴定。
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