[发明专利]清除干扰遗传数据,并使用遗传数据进行预测的方法和体系在审

专利信息
申请号: 200680049316.3 申请日: 2006-11-22
公开(公告)号: CN101346724A 公开(公告)日: 2009-01-14
发明(设计)人: M·罗比诺威特茨;M·班杰维齐;Z·P·德姆科;D·S·约翰逊 申请(专利权)人: 纳特拉公司
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18;G06F19/22
代理公司: 北京同达信恒知识产权代理有限公司 11291 代理人: 黄志华
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 对于单个细胞或者一小组细胞,或者从片段DNA中测定的遗传数据的方法以及体系,其中可获得一定数量的遗传数据,根据数学模型以及给定的个体遗传数据、表型数据和/或临床数据、以及来自于关系密切的患者次族群的由遗传型数据、表型数据和/或临床数据组成的相关医学数据集合,该方法以及体系也可以用来预测可能的表型结果。使用已知的方法获得并扩增目标个体的遗传数据,根据目标染色体组以及遗传相关宿主的染色体组之间存在的预期相似性,对未测定的碱基对、缺失等位基因以及缺失区域进行重建。
搜索关键词: 清除 干扰 遗传 数据 使用 进行 预测 方法 体系
【主权项】:
1.一种体外增加测定的目标个体遗传数据准确性的系统,使用至少一位相关个体的遗传数据,其中所述目标个体是胚胎或胎儿,其中所述相关个体包括目标个体的双亲的一方或双方,该系统包括:获得目标个体基因组特异性遗传数据和相关个体基因组特异性遗传数据,其中所述的遗传数据包括单个染色体上多个单核苷酸的多态性,其中所述的遗传数据是从目标个体和相关个体分离出来的,从而在目标个体和相关个体的体外进行以下步骤;依照在所述的目标个体的染色体组中发现的那些片段,建立一个或者一个以上假设,这些假设是关于哪些染色体中的哪些片段是来自于所述的相关个体的,给定所述的目标个体的遗传数据以及与该目标个体相关的相关个体的遗传数据并考虑了减数分裂过程中发生DNA交叉的可能性,确定每种假设的概率,并且利用与每种假设相关联的概率来确定所述的目标个体的真实遗传物质的最可能的状态,从而增加目标个体遗传数据的准确性。
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