[发明专利]蛋白质三维结构的预测方法有效
| 申请号： | 200710098715.5 | 申请日： | 2007-04-25 |
| 公开（公告）号： | CN101294970A | 公开（公告）日： | 2008-10-29 |
| 发明（设计）人： | 唐鹤云;张正国;杨啸林;郭亚峰 | 申请（专利权）人： | 中国医学科学院基础医学研究所 |
| 主分类号： | G01N35/00 | 分类号： | G01N35/00;G06F19/00 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人： | 程伟 |
| 地址： | 1000*** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供了一种预测蛋白质三维结构的方法。该方法通过1)将要预测三维结构的目标蛋白质序列中的一个氨基酸(例如第一个)设定预测坐标值，2)以1)中的下一个氨基酸(例如第二个)为中央氨基酸在目标序列中分割一个九肽片段，3)在九肽片段数据库中搜索与步骤2)的序列最佳匹配的九肽片段，4)根据搜索出的最佳匹配片段的中央氨基酸的相对坐标计算目标九肽片段中央氨基酸的坐标，将其装配到目标蛋白上，5)以目标序列的下一个氨基酸(例如第三个)作为下一个中央氨基酸重复进行上述的分割、搜索、装配步骤，直至最后一个氨基酸装配结束。该方法获得的目标蛋白质序列结构具有较好的精度，解决了侧链安置问题，运算量小，计算速度快。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质 三维 结构 预测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种预测蛋白质三维结构的方法。其包括如下步骤：1)以目标序列的第一个氨基酸作为预测的起点设定其坐标值，2)分割目标序列，以该序列的第二个氨基酸为一个九肽片段的中央氨基酸，即第五个氨基酸，在序列中截取九肽长度的片段，不足的部分用空格补齐，3)搜索与步骤2)中所截得的片段最佳匹配的九肽片段，4)根据搜索出的最佳匹配片段的中央氨基酸的相对坐标计算目标九肽片段中央氨基酸的坐标，将其装配到目标蛋白上，5)装配完成上述第二个氨基酸之后，沿目标序列移至第三个氨基酸，并以第三个氨基酸作为下一个中央氨基酸重复进行上述步骤2)至步骤4)的截取、搜索、装配步骤，直至最后一个氨基酸装配结束。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国医学科学院基础医学研究所，未经中国医学科学院基础医学研究所许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/200710098715.5/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：一种高碳钢线材中渗碳体的检验和评价方法
- 下一篇：一种网箱养殖黄姑鱼的方法
