[发明专利]鸭肠炎病毒基因组DNA的提取及其序列无效
申请号: | 200710114227.9 | 申请日: | 2007-11-12 |
公开(公告)号: | CN101182526A | 公开(公告)日: | 2008-05-21 |
发明(设计)人: | 李玉峰;宋敏训;史玉颖;黄兵;马秀丽;吴静;于可响 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院家禽研究所 |
主分类号: | C12N15/33 | 分类号: | C12N15/33 |
代理公司: | 济南诚智商标专利事务所有限公司 | 代理人: | 王汝银 |
地址: | 250023山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明公开了一种鸭肠炎病毒(Duck Enteritis Virus,DEV)基因组DNA的提取方法和基因组序列。首先利用高渗缓冲液裂解感染DEV的鸡胚成纤维细胞(CEF),然后加入核酸酶消化细胞DNA,再用酚/氯仿抽提的方法获得病毒基因组DNA。将所得样品随机打断为2.0~2.5kb片段,连接入pUC19载体,转化宿主大肠杆菌构建基因组文库。对文库中的阳性克隆进行随机测序,测序总长度对病毒基因组的覆盖率为6倍。测序结果经拼接和组装,获得了全长为156512bp的DEV全基因组序列,分析发现基因组结构与α-疱疹病毒亚科水痘病毒属成员一致,为DEV的分类提供了理论依据。 | ||
搜索关键词: | 肠炎 病毒 基因组 dna 提取 及其 序列 | ||
【主权项】:
1.鸭肠炎病毒基因组DNA序列,其特征在于,全部核苷酸序列长度为156512 bp,至少编码78个开发阅读框,基因编码的氨基酸序列与α-亚科疱疹病毒具有同源性,其中5个基因仅与目前所知的禽疱疹病毒有同源性,基因组结构与水痘病毒属相一致,该序列为:SEQ NO.1。
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